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5 《微生物宏基因组分析实操》课程，配制分析环境（doc.sh）遇到Bug

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5 Path 'manifest.txt' does not exist.是合并后的数据，export share_nas1=/work/data manifest=$workdir/manifest.ckd.txt 这样设置有问题吗？

  • 2024-02-25 09:55
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3 完全按照课程来的，这个wsl版本是不有问题啊？

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3 Beta多样性分析PCOA/NMDS分析无差异，Adonis检验P值小于0.05，怎么看结果？

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10 老师您好，请问我mac电脑如何启动镜像

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100 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时，即聚类生成OTU-denovo时老是报错，查看类似问题后，升级了运行内存为70g，同时将教程内的30多个样本减成2个样本，FASTQ格式还有qimme格式检查都正确，依旧报错，报错内容如下：Segmentation fault

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5 小白刚开始学，请问这是为什么，做了好几天了还是不知道怎么做，恳求指导谢谢

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5 qiime2调用dada2报错

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10 您好，我在用qiime2进行扩增子测序分析但是导入数据时会一直出现改错误，请问有什么合适的解决办法吗?

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10 老师，您好，在用qiime2 运行dada2 时，报错

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5 qiime1使用level_tree_sample.py脚本时出现报错

  • J,H 2022-02-08 22:20
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5 OTU分析时报错

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5 扩增子测序分析，qiime1的assign_taxonomy.py命令中，如果用blast方法比对序列，可否修改比对的相似度阈值（比如identity或者similarity）？

  • bugz 2021-12-22 19:03
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10 老师，您好，我想请问一下，conet分析时，如果不加环境因子的时候可以正常运行，但是加上环境因子就不行，想问一下是什么原因？下面是我环境因子的格式，我用notepad++转换成文本格式了

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10 老师 ，您好，我想请问一下qiime2双端拆分barcode的事情，如果您回复，将感激不尽

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5 您好，我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文，发现自己做到最后一步，数据库训练时一直显示内存不够，除了增加内存，还有没有其他的办法解决这个问题？例如，设置那些参数之类的？或者，我还要多大的内存才能做呢？谢谢

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5 老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？

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5 疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 20:37
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10 如何批量根据微生物种属名称下载某一功能蛋白的氨基酸或核酸序列？

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5 你好 我现在在用cytoscape的conet做共现网络分析图，去掉世系之后确实是可以运行正常的，但是我做的图是需要世系的，因为需要标出图例，表明是在门分类下 具体是哪种微生物，请问我要怎么去调整taxonomy的数据格式才能使得conet不报错

  • 2019-07-31 11:12