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请问功能注释里面,想注释KEGG
George
2024-12-24 11:15
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binning功能注释
George
2024-12-24 22:32
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想请教一下,我是基于windows+docker做的宏基因组注释,然后在去宿主这一步,卡住了 不知道为啥 一直不动
宏基因组
George
2024-12-20 19:09
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请问,我弄了一个256线程,1t内存的服务器,想处理500G的宏基因组注释,大概需要跑多少天,全套下来
宏基因组
George
2025-01-01 07:11
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不知道为什么,产生不了unmap文件
宏基因组
George
2024-12-23 09:44
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已经windows系统里下载了docker 也打开了,但还是运行不了. doc.sh
George
2024-12-17 15:13
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想咨询一下,宏基因组功能注释的视频中,有一步是用cds.fa文件注释物种,想咨询一下,这个物种注释出来后,应该如何计算丰度?是根据前面cds.count来计算吗,这样计算出的物种丰度可靠吗?因为有些物种可能基因很多。
宏基因组
George
2025-01-02 02:36
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想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
宏基因组
George
2025-01-02 02:39
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宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表,混合组装呢
基因丰度表
murakami
2024-12-17 17:32
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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗?
TPM
murakami
2024-12-17 16:39
1
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binning 想做功能注释,但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释?
宏基因组
George
2025-01-02 14:56
1
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1153
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binning物种注释的时候,gtdbtk软件和数据包已经更新,旧版的匹配不上,请问应该怎么更新一下软件,谢谢
宏基因组
George
2025-01-02 11:44
2
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想咨询一下老师,这个图大概是咋做出来的,应该用到什么样格式的数据,在网上没搜到教程,主要是需要什么数据,谢谢老师
1
George
2025-03-12 12:54
1
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想要获取一下metagenomics:v1.0本地百度网盘镜像,谢谢
宏基因组
George
2024-12-14 12:48
2
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CAZy注释阶段,hmmer的太慢占用cpu只有一直很少
murakami
2025-02-19 11:45
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lefse分析细节
murakami
2025-03-12 13:08
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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释
KEGG注释
murakami
2025-02-27 15:44
0
回答
989
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10
老师您好,我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时,megahit报错Exit code -9
宏基因组
Zz1
2025-05-27 11:03
1
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980
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想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
George
2025-01-02 02:39
1
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975
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想咨询一下,我有1批宏基因组数据,可不可以样本对半,分成2次进行
George
2025-02-19 11:53
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