10 使用get_gene_length_from_gtf.py脚本统计基因长度时报错

NCBI上下的gff文件,然后用gffread转换为了gtf文件,然后使用get_gene_length_from_gtf.py 这个python脚本统计,都是教程上的步骤,然后就报错了

报错信息如下

Traceback (most recent call last):

  File "../script_new/get_gene_length_from_gtf.py", line 48, in <module>

    kvs=get_value(tmp[8])

  File "../script_new/get_gene_length_from_gtf.py", line 36, in get_value

    k,v=re.split(r'\s+',i)

ValueError: too many values to unpack


请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

需要看看你的GTF文件格式是否有异常;可以把GTF文件发给我看看; 

请先 登录 后评论