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hisat进行转录组索引比对，程序运行结束，没有报错，只生成summary和sam格式文件，bam和bam.bai格式文件未生成，请问是什么原因？

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老师您好，请问有蛋白互作实验如酵母双杂单杂，双分子荧光互补，双荧光素酶等的视频吗

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老师，这是做转录组分析建立的索引，您看看对不对

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reads 与基因组进行比对map

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老师，你好！ATAC-seq数据分析中，peak是clean reads拼接后得到的序列么？

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从NCBI下载了转录组数据，文件类型为文件，这类数据能不能分析

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老师您好，我要准备挑选一个物种多个基因的转录本，请问如何选择代表性的转录本以作分析？

  • John 2020-11-20 17:32
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做转录组分析建立索引时，出现如图的问题，看资料是mRNA和cDNA名称一样，问老师，老师发了一个连接，里面有一个 AWK命令，老师建议修改一下，自己按照理解，修改了一下，但一直未达到目标，想问一下老师，怎么修改！

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请问下载了docker如何学习Linux，看哪个课程，我的电脑是macOS

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求助mRNA ID 批量+1问题

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老师，您好，按照教程，启动镜像后，要设置路径变量，按要求运行代码后，输入进入refdir的命令，显示没有这个文件夹，这是怎么回事？

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老师，在建立索引时，棉花整个基因组较大，对内存要求较高，棉花基因组由26染色体组成，可否单独对26条染色体建立索引，然后合并？

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老师，在建立索引时整个基因组跑数据需要内存大，能不能把基因组分开不同的染色体，做完索引在合并？

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老师，如果租用服务器，内存得选多大的？

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老师，我做的物种是棉花，基因组约3.5G 利用组学大讲堂的方法建立索引失败，应该是内存不够，一般的电脑都是这样的，即使使用的小型服务器内存也达不到100G,这个问题应该怎么解决，这一步无法解决，后续无法分析，老师可否给一个可行性的意见！

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我用docker omicsclass/rnaseq 下载ncbi上转录组数据总是出现下面的问题

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3 RNAseq转录组-基因差异表达分析

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老师，您好，我导入虚拟机时出现需要禁用硬件虚拟化，这个要怎么设置呢？

1 解决

关于差异基因表达的问题

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老师您好，请问一下gene location 下面的（+）、（-）表示的是什么呀