ggplot2 绘图 离散型颜色选择 ColorBrewer

利用ggplot2绘图 scale_fill_brewer() 或者scale_color_brewer() 会使用到ColorBrewer 配色。可以利用相关的命令查看改配色方案。 library(ggplot2)RColorBrewer::display.brewer.all() 通...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-13 16:53
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perl 从数组随机抽取元素

perl中如何随机抽取数组中的一个元素。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-13 13:51
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SMB1.0客户端导致的网络驱动器(群辉NAS存储)上的文件无法打开查看编辑等问题(win10)

登陆网络共享存储,找到预处理的文件,结果发现文件打不开,无法编辑,甚至拷贝都出现权限受限问题。但是查看整个权限设置一点问题都没有~~~why? 切换到其他电脑上进行登陆,又没有这个问...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-11 16:36
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ActivePerl自带的PPM软件无响应

ActivePerl安装perl模块

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-09 16:41
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TCGA数据发表5分文章

TCGA的一篇五分文章

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 17:22
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小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
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基因ID 转换

生物信息学 基因 ID 转换

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-05 16:08
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统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

R统计不同差异组合,上下调基因个数;并用ggplot2绘制柱状图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-03 14:02
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图片去除大块黑色区域

在使用MEGAN软件绘制分类学树状图时,如果物种较少,生成的图片会有大片的黑色区域,很不美观。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 14:55
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植物转录因子调控分析

介绍plantregmap网站的一些分析转录因子的功能

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-29 13:40
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单拷贝直系同源基因构建系统发育树以及分歧时间

跨物种研究物种遗传进化方法

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-27 13:06
  • 阅读 ( 12674 )

perl 中glob函数

perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能,文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-22 14:29
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计算串联重复基因KaKs的时候,aln文件一定要通过脚本转换为axt文件么?这两种文件格式是否可以直接通过修改扩展名来实现?

最近有关计算KaKs的输入文件,有人提出了问题,说是不是可以通过修改后缀名称aln变为axt来改变文件,变成软件可识别的格式?答案是不可以的,因为aln文件跟axt文件的格式是不一样的,因此只能通...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-22 12:07
  • 阅读 ( 4871 )

GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

GEO2R是GEO在线分析工具,基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:19
  • 阅读 ( 38999 )

readxl包读取excel的多个函数简介

readxl包括多个可以读取excel的函数,比之xlsx包更方便

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 16:09
  • 阅读 ( 7165 )

rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验

rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-15 11:25
  • 阅读 ( 6063 )

对组装结果中GAP左右批量设计引物

对组装结果中GAP左右批量设计引物

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-15 11:21
  • 阅读 ( 4162 )

GSEA分析需要的文件及格式

在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候,需要四个文件: 1、基因表达数据文件; 2、表型数据文件; 3、功能基因集文件; 4、芯片注释文件; 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-14 15:11
  • 阅读 ( 22707 )

绘制基因结构图软件GSDS使用过程中图片的修改问题

在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时,如果图例太多,在网页展示不出来,这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了,点击下图红色箭头所指按钮,进入到图片编辑界面: 拉...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-14 14:48
  • 阅读 ( 11943 )

生存分析的一些基本概念

生存分析的一些基本概念

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-14 10:58
  • 阅读 ( 5890 )