安装R包的几种方法

常见的两种R包的安装方法

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• microRNA
• 发布于 2018-11-15 16:56
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NCBI中SRA数据库简介

SRA数据库简介

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• omicsgene
• 发布于 2018-11-13 22:31
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CGVIEW：微生物基因组和质粒圈图绘制分析软件

CGVIEW：微生物基因组分析软件

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• omicsgene
• 发布于 2018-11-13 13:43
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linux下samtools安装指南

linux下samtools安装指南

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• 安生水
• 发布于 2018-11-01 10:03
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MCscan报错——kpsewhich命令缺失

kpsewhich命令缺失导致jcvi运行报错

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• 安生水
• 发布于 2018-10-29 19:21
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GSDS基因promoter区绘制顺势作用原件出现异常

GSDS问题解决

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• omicsgene
• 发布于 2018-10-29 10:12
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GEO数据库dataset和profiles区别

GEOdataset

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• omicsgene
• 发布于 2018-10-28 06:58
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对R包的操作（查询、版本、更新等）

R中对包进行操作的命令很多，涉及从包的安装、查询、更新、卸载等等。这里介绍几个常见的操作

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• Daitoue
• 发布于 2018-10-24 16:01
• 阅读 ( 17780 )

蛋白质组分析软件MaxQuant

蛋白质组分析软件MaxQuant

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• microRNA
• 发布于 2018-10-19 17:01
• 阅读 ( 7356 )

MEME使用参数说明

MEME参数使用说明使用说明

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• omicsgene
• 发布于 2018-10-19 17:00
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pheatmap返回的结果解释（获得新的排序信息）

pheatmap是一个热图绘制的R包，全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap()，对应的数据则是一个数值矩阵，譬如基于如下的矩阵10X6： > mat              CK-WT-1      CK-WT-2     ...

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• Daitoue
• 发布于 2018-10-19 14:23
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miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

miRTarBase- 一个收录经实验验证的miRNA靶基因数据库

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• microRNA
• 发布于 2018-10-12 16:41
• 阅读 ( 10060 )

mcsan结果文件说明

mcsan结果文件说明

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• 安生水
• 发布于 2018-10-12 13:56
• 阅读 ( 4910 )

三个基因组共线性分析

三个基因组共线性分析

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• 安生水
• 发布于 2018-10-12 13:42
• 阅读 ( 20186 )

lncRNA调控预测

3种lncRNA互作模式的预测

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• microRNA
• 发布于 2018-10-12 11:30
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网络概念以及Cytoscape导入数据格式理解（ceRNA等多元关系网络数据）

复杂网络(可参考维基百科Complex network、Network theory)由多个基本单元( 或节点) 与它们之间的相互作用( 即连线) 组成,典型的例子有互联网、神经网络和各类生物网络（包括代谢网络、基因调...

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• Daitoue
• 发布于 2018-10-09 14:37
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ggplot2点图geom_point中点的shape有多少？

ggplot2可以利用geom_point绘制散点图，而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢？(注意此处只介绍shape的设定，不是aes(shape)映射） 可以通过查询?shape 获得以下内容： # Shape exampl...

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• Daitoue
• 发布于 2018-09-30 16:59
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hmmsearch寻找相似序列

hmmsearch寻找相似序列

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• 安生水
• 发布于 2018-09-30 14:55
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HGMD人类变异数据库ANNOVAR注释使用转换格式

HGMD人类变异数据库ANNOVAR注释使用

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• 发布于 2018-09-27 16:55
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MeV 绘制热图过程如何对图片颜色做出修改

利用MeV绘制热图，方法可参考： http://www.omicsclass.com/article/263   其中对热图颜色模式进行修改主要在Display中完成，具体可以通过Display-->Color Scheme 进行（见下图）： Gree...

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• Daitoue
• 发布于 2018-09-14 15:57
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