biolinux打不开
利用公共数据发文章,基因家族好思路。 虽然我们一直在说可以“用别人的数据,写自己的文章”,但是具体怎么操作,很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。 读前准...
4个甜瓜重测序绘制抗白粉变异图谱[1]发PLoS ONE
混池测序做遗传进化,分析受选择基因
跟着PNAS学微生物多样性分析!
给大家介绍一类代表包含关系的图,那就是韦恩图。
5个转录组也能发4分文章,想要少投入,多产出,既要站在巨人的肩膀上,也得打铁还需自身硬啊!
您有大量的品种资源么?您想发高分文章么?群体进化和GWAS分析助您心想事成!
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在群体遗传学研究中,我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型,能够有效地分析群体间的遗传...
在群体遗传学研究中,构建系统发育树是解析群体遗传结构和演化历史的核心手段。无论是单核苷酸多态性(SNP)分析、单倍型网络构建,还是群体分化研究,研究者常面临一个挑战:如何将复杂的群体...
当我们想在linux下批量处理数据时,用到的脚本需要达到我们想要处理的效果,这时就需要我们对脚本进行修改编写。 但是对于初学者来说,一些生信脚本是非常晦涩难懂的,google百度得到的回答也...
在微生物组研究中,揭示群落组成与动态变化是核心任务。无论是16S rRNA测序、宏基因组分析,还是环境样本的物种丰度比较,研究者常需面对一个关键问题:如何直观展示多个样本在不同分类水平(如...
“ 饼图(扇形图)时常用于对统计数据的可视化,在 R中,很多R包用于绘制饼图,例如ggplot2、ggsunburst就能绘制出好看的饼图,操作如下” 1. 加载所需要的包 library(RColorBrewer) #调色模板...
连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)是指在某一个群体中,不同位置上的两个基因座同时遗传的频率明显高于预期的随机频率现象,一般用D,D'和r²来表示LD的程度。
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GATK是我们重测序流程中经常使用到的软件,他的下载比较简单,但是今天在配置的时候出现了一点小问题 下载 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/archive/refs/tags/4.6.2.0.tar.gzta...
相关性分析作为一种强大的工具,能够帮助我们量化变量间的关联程度。
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空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)