全部 - 文章 - 第6页 - 组学大讲堂问答社区

awk正则表达式使用外部变量

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omicsgene
发布于 2024-02-04 11:35
阅读 ( 625 )

vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题

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xun
发布于 2024-02-02 14:24
阅读 ( 688 )

2024最新版《基因家族分析实操》直播培训开始报名了！

快来参加组学大讲堂直播课程，两天时间实现SCI自由！我们使用关键词“genome wide gene family”粗略统计了近3年基因家族分析类SCI数量：2021年1912篇，2022年2111篇，2023年1890篇。考虑到...

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生信老顽童
发布于 2024-02-01 11:46
阅读 ( 758 )

lnd无法下载样本名称含有+的数据

linuxnd linuxnd是linux系统下载诺禾致源测序数据的软件，其基础功能如list、cp、cp -d 已经在这篇文章中给大家列出： https://www.omicsclass.com/article/2084 错误的产生该软件在遇到...

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Ti Amo
发布于 2024-01-31 10:52
阅读 ( 540 )

代谢组数据上传NGDC！简单又快捷！

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安生水
发布于 2024-01-30 17:59
阅读 ( 1880 )

R语言按列合并文件，并保持其中一个文件的原有顺序

1.join函数；2.创建新的顺序变量；3.inner_join函数

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星莓
发布于 2024-01-30 17:49
阅读 ( 839 )

CLUMPAK安装

CLUMPAK这个软件很古老,安装起来也很麻烦,记录一下https://tau.evolseq.net/clumpak/download/CLUMPAK.zip 安装包下载路径解压以后添加库的位置到环境 export PERL5LIB=path/CLUMPAK:$PERL5LI...

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xun
发布于 2024-01-26 17:02
阅读 ( 687 )

使用R语言安装包编译时gcc标准报错——“error: for loop initial declarations are only allowed in C99 mode”

使用BiocManager安装R包时gcc标准报错

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每天学习一点点
发布于 2024-01-26 10:52
阅读 ( 490 )

桑基图绘制

桑基图是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名，此后便以其名字命名为“桑基图”。...

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Ti Amo
发布于 2024-01-23 17:49
阅读 ( 506 )

blast 中的e-value值如何理解？

对e-value值的by chance 进行解释

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每天学习一点点
发布于 2024-01-23 16:32
阅读 ( 1317 )

topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes()，其中提供的第二个参数不能有0，否则会报错： showSigOfNodes()拆分之后是： sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的 ...

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Ti Amo
发布于 2024-01-22 11:51
阅读 ( 579 )

扩增子序列直接物种注释代码

扩增子单条序列注释汇总代码如下 import rewith...

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xun
发布于 2024-01-22 11:23
阅读 ( 586 )

rMATS turbo使用

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安生水
发布于 2024-01-17 11:30
阅读 ( 818 )

R语言使用ggraph绘图导出pdf报错——“invalid font type”

使用ggraph绘图，在结果导出pdf的时候报错，不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出，可以直接载入字体： library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/T...

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每天学习一点点
发布于 2024-01-11 14:14
阅读 ( 597 )

如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

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星莓
发布于 2024-01-11 14:09
阅读 ( 3814 )

seqcluster软件安装

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安生水
发布于 2024-01-10 13:38
阅读 ( 688 )

超快的文件传输软件trzsz

对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...

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xun
发布于 2024-01-09 10:56
阅读 ( 620 )

Rna-seq 去除批次效应ComBat-seq

ComBat-seq

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omicsgene
发布于 2024-01-09 10:54
阅读 ( 781 )

ftp链接登陆下载文件

我们进行文件下载的时候通常可以直接通过网页的download或者是服务器的wget命令，但是是一个需要登陆的ftp地址，这两个方法就不太适用了，本文提供给大家一些ftp地址的登陆方法。 1. 个人电...

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Ti Amo
发布于 2024-01-08 10:41
阅读 ( 666 )

sort -V | 对字符和数值组合的排序

sort命令有很多选项参数，其中-n选项可以对文件内容进行数字排序。但是当想排序的列是由字符和数字组成的时候，这个选项就不能达到想要的效果。 1.例如，对某个文件列进行排序： #cat 1.txt11...

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rzx
发布于 2024-01-05 13:28
阅读 ( 732 )