qiime自带的alpha_diversity.py脚本报错

alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-11 09:43
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bcftools创建vcf索引失败

bcftools创建vcf索引失败

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  • 安生水
  • 发布于 2024-03-18 13:44
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svg2xxx运行报错

/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Ma...

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  • xun
  • 发布于 2024-03-26 11:31
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tassel PCA报错

tassel 跑PCA的时候由于SNP位点太多报错

SNP 过滤标准保证数据质量及参考文献:

最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释,这里总结一下相关的参考文献和标准的出处

利用vcftools分析玉米和大刍草基因组区域或基因区域是否受到选择

通过已经发表的玉米和大刍草基因组变异数据来计算感兴趣的基因组位置上,是否受到选择。主要是比较大刍草和玉米之间,该区间的多样性是否会下降,如果该区域内SNP的多态性下降,表明该区域内受到了选择。

sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错

sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错

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  • 安生水
  • 发布于 2024-04-12 10:29
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IF=8.7 | T2T康乃馨基因组揭示了相同基因在不同单倍型基因组中的表达差异

2024年1月 Horticulture Research杂志在线发表了一篇题为“The haplotype-resolved telomere-to-telomere carnation (Dianthus caryophyllus) genome reveals the correlation between genome ar...

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  • Ti Amo
  • 发布于 3天前
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遗传图构建-SNP标记分型

遗传图构建-SNP标记分型

R 安装包:configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

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