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不管是重测序或者是有参转录组,很重要的一环就是将测序数据比对到参考基因组上。一般来说,常用比对软件都可以正常运行结束,但是当碰到超大基因组的时候难免会碰到一些问题,这些问题有的时候...
筛选出能比对到参考序列的reads,形成新的fastq文件
相对其他比对软件而言,STAR的比对速度极快,如果有足够的内存(至少需要30G),就可以用STAR来分析。