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如何快速获取多条序列长度信息

如何快速知道你的多个序列的长度呢？这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具，samtools。命令行格式：samtools faidx   xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-11 11:31
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Excel数据分析技巧之方差分析

做方差分析，用Excel，简单、快捷、方便，你值得拥有！

在组学大讲堂云服务器上使用deepseek驱动Claude code

组学大讲堂云服务器已经部署好了Claude code，再配置一下大模型的API key就可以使用了

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  • omics007
  • 发布于 2026-06-04 15:27
  • 阅读 ( 140 )

使用filezilla无法上传或者下载数据的常见问题解决方案

使用filezilla时，比较常见的报错是Access denied，可以按如下顺序进行检查： 1、检查主机地址是否正确？组学大讲堂的主机地址是：sftp://omicsclass.com 2、检查密码是否正确，复制密码后可...

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  • omics007
  • 发布于 2026-03-31 14:28
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百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go上传失败

获取用户uk错误, 请确保登录信息包含了STOKEN, 获取UK

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  • 安生水
  • 发布于 2026-03-06 13:47
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python版本xpclr报错

报错内容： ImportError: cannot import name 'romberg' from 'scipy.integrate' 可以看一下，基本上是这个脚本的第六行存在调用： ~/biosoft/conda/miniconda3/lib/python3.12/site-package...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2026-01-21 15:57
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PfamScan运行报错：FATAL: error running translate (usage: translate [-h] [-d DEST] [-s SRC] [-c] text

报错原因： PfamScan运行的时候会调用hmmer的translate，而在我环境中默认是python下面的translate 解决办法： export PATH=/biosoft/hmmer/squid/:$PATH

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  • Ti Amo
  • 发布于 2026-01-08 13:25
  • 阅读 ( 449 )

孟德尔随机化(MR)

前面的文章中我们给大家介绍过eQTL和sQTL的概念, 大体总结一下，eQTL是指基因组上的一些突变可以改变相关基因的表达，sQTL是指这些突变同时也会导致可变剪接的差异,实际上这两个都是归于一个叫...

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  • xun
  • 发布于 2026-01-05 17:41
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STAR构建基因组索引报错

报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...

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  • rzx
  • 发布于 2025-12-30 09:22
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cactus报错：Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus XML

报错： 运行cactus-pangenome的时候报错： [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-07-07 17:09
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deepseek绘图之--FPKM小提琴图

deepseek绘图之--FPKM小提琴图

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  • 安生水
  • 发布于 2025-05-14 09:24
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Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具

在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2025-04-30 10:31
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使用AI批量统计fastq文件的测序量

我的文件夹下面几十个样本的双端测序数据，需要进行数据量的统计，让AI帮我批量编写代码整理一下

ai助手帮我画环形堆叠柱状图

前两天看文章里面有一个很漂亮的环形堆叠柱状图,但是我懒得查资料,所以我尝试让ai帮我画一下 结果如下,这个是完整 的链接  https://www.cici.com/thread/w0ed44c9006bd080c 还是可以的...

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  • xun
  • 发布于 2025-03-28 11:03
  • 阅读 ( 3038 )

ai助手帮我构建新的qiime2分类器

在挖掘数据的时候发现有的数据用的是v2版本的,我手里只有全长的和v3-v4的,全长效果没那么好感觉,但是我好久没有看过qii2相关的东西了,有点忘了,刚好最近ai很火,我就尝试用ai帮我构建,过程如下...

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  • xun
  • 发布于 2025-03-28 09:58
  • 阅读 ( 3085 )

AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机root密码

AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机root密码

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  • 安生水
  • 发布于 2025-03-27 15:16
  • 阅读 ( 3427 )

AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机内存大小

AI助手帮我解决如何修改kvm虚拟机内存大小

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  • 安生水
  • 发布于 2025-03-27 14:57
  • 阅读 ( 2951 )

Mfuzz做时间聚类分析

Mfuzz做时间聚类分析

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  • 安生水
  • 发布于 2025-01-02 16:23
  • 阅读 ( 5845 )

BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed

在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错： [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...

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  • rzx
  • 发布于 2024-12-19 17:17
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samtools | 提取部分染色体的bam信息

01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam

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  • rzx
  • 发布于 2024-12-19 16:28
  • 阅读 ( 5048 )