Treemix 软件：群体基因交流分析的得力工具
在群体遗传学研究中，我们常常渴望揭开不同群体之间复杂的遗传关系以及基因流动的神秘面纱。Treemix 是一款专注于推断群体间基因流的软件。它通过构建群体遗传模型，能够有效地分析群体间的遗传...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-04-30 10:31
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Ti Amo
使用AI批量统计fastq文件的测序量
我的文件夹下面几十个样本的双端测序数据，需要进行数据量的统计，让AI帮我批量编写代码整理一下
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- 每天学习一点点
- 发布于 2025-04-02 14:26
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每天学习一点点
ai助手帮我画环形堆叠柱状图
前两天看文章里面有一个很漂亮的环形堆叠柱状图,但是我懒得查资料,所以我尝试让ai帮我画一下 结果如下,这个是完整 的链接 https://www.cici.com/thread/w0ed44c9006bd080c 还是可以的...
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- xun
- 发布于 2025-03-28 11:03
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xun
ai助手帮我构建新的qiime2分类器
在挖掘数据的时候发现有的数据用的是v2版本的,我手里只有全长的和v3-v4的,全长效果没那么好感觉,但是我好久没有看过qii2相关的东西了,有点忘了,刚好最近ai很火,我就尝试用ai帮我构建,过程如下...
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- xun
- 发布于 2025-03-28 09:58
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安生水
BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed
在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错： [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 17:17
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rzx
samtools | 提取部分染色体的bam信息
01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 16:28
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Trinity报错“Error, not recognizing read name formatting”
在使用trinity做de novo的时候，发现软件报错了
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-12-18 14:38
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hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
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- 安生水
- 发布于 2024-12-11 15:15
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linux 编码转换
在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法： 1. vim 打开二进制文件： vim -b 文件 将内容转换成16进制： :%!xxd 转换回来： :%!xxd -r 2. iconv # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-12-03 14:56
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annovar的染色体识别问题
如果是非数字形式的染色体编号（尤其是其中有特殊字符），annovar的注释可能会有问题，需要改成数字格式
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-11-22 10:02
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seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选
seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除
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- rzx
- 发布于 2024-11-19 19:01
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HiC-Pro 报错检索解决
报错： 运行HiC-Pro的时候出现报错： 去看log文件发现： 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找： 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件，看一...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-28 15:12
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perl报错：symbol lookup error: xxxxx: undefined symbol: Perl_xs_handshake
glimmhmm是一个基因从头预测的软件，他的运行需要先训练模型再预测基因 报错： 运行trainGlimmerHMM的时候出现报错”undefined symbol: Perl_xs_handshake“ 问题： per调用的lib里面没有相关...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-10-22 13:55
- 阅读 ( 1404 )
ifconfig不显示ip
如题,在ifconfig的时候如果没有出现IP地址,同时确保自己网络连接没问题 nmcli con show NAME UUID TYPE DEVICE eno1 1377a295-708b-4cb4-a1cb-0...
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- xun
- 发布于 2024-10-10 15:57
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SRA Toolkit 工具首次使用提示“This sra toolkit installation has not been configured”
SRA Toolkit 是一套由 NCBI (National Center for Biotechnology Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-09-09 16:31
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