软件工具 - 推荐的文章 - 第9页 - 组学大讲堂问答社区

如何快速获取多条序列长度信息

如何快速知道你的多个序列的长度呢？这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具，samtools。命令行格式：samtools faidx xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在...

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landy
发布于 2018-05-11 11:31
阅读 ( 4877 )

Excel数据分析技巧之方差分析

做方差分析，用Excel，简单、快捷、方便，你值得拥有！

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生信老顽童
发布于 2018-04-21 17:44
阅读 ( 6672 )

PASA报错与续跑

PASA运行过程报错： Running CMD: /share/work/biosoft/PASApipeline/PASApipeline-v2.5.2/scripts/update_alignment_status.dbi -M 'pasa.sqlite' < alignment.validations.output > p...

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Ti Amo
发布于 2026-09-01 16:22
阅读 ( 131 )

Hi-C pro报错：Pairing of R1 and R2 tags ... Logs: logs/Acer/mergeSAM.log make: *** [bowtie_pairing] Error 1

这个是hic pro得使用： usage : HiC-Pro -i INPUT -o OUTPUT -c CONFIG [-s ANALYSIS_STEP] [-p] [-h] [-v]Use option -h|--help for more informationHiC-Pro 3.1.0---------------OPTIONS ...

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Ti Amo
发布于 2026-08-19 17:31
阅读 ( 336 )

在组学大讲堂云服务器上使用deepseek驱动Claude code

组学大讲堂云服务器已经部署好了Claude code，再配置一下大模型的API key就可以使用了

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omics007
发布于 2026-06-04 15:27
阅读 ( 896 )

使用filezilla无法上传或者下载数据的常见问题解决方案

使用filezilla时，比较常见的报错是Access denied，可以按如下顺序进行检查： 1、检查主机地址是否正确？组学大讲堂的主机地址是：sftp://omicsclass.com 2、检查密码是否正确，复制密码后可...

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omics007
发布于 2026-03-31 14:28
阅读 ( 1242 )

百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go上传失败

获取用户uk错误, 请确保登录信息包含了STOKEN, 获取UK

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安生水
发布于 2026-03-06 13:47
阅读 ( 2282 )

python版本xpclr报错

报错内容： ImportError: cannot import name 'romberg' from 'scipy.integrate' 可以看一下，基本上是这个脚本的第六行存在调用： ~/biosoft/conda/miniconda3/lib/python3.12/site-package...

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Ti Amo
发布于 2026-01-21 15:57
阅读 ( 1132 )

PfamScan运行报错：FATAL: error running translate (usage: translate [-h] [-d DEST] [-s SRC] [-c] text

报错原因： PfamScan运行的时候会调用hmmer的translate，而在我环境中默认是python下面的translate 解决办法： export PATH=/biosoft/hmmer/squid/:$PATH

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Ti Amo
发布于 2026-01-08 13:25
阅读 ( 819 )

孟德尔随机化(MR)

前面的文章中我们给大家介绍过eQTL和sQTL的概念, 大体总结一下，eQTL是指基因组上的一些突变可以改变相关基因的表达，sQTL是指这些突变同时也会导致可变剪接的差异,实际上这两个都是归于一个叫...

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xun
发布于 2026-01-05 17:41
阅读 ( 2224 )

STAR构建基因组索引报错

报错提示： Fatal LIMIT error: the number of junctions to be inserted on the fly =1412348 is larger than the limitSjdbInsertNsj=1000000Fatal LIMIT error: the number of junctions to...

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rzx
发布于 2025-12-30 09:22
阅读 ( 857 )

cactus报错：Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus XML

报错：运行cactus-pangenome的时候报错： [MainThread] [I] [toil-rt] cactus_consolidated:ERROR: ERROR: Failed to get attribute: partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows from cactus...