软件工具 - 推荐的文章 - 第2页 - 组学大讲堂问答社区

你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后，会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件！

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安生水
发布于 2018-06-29 09:33
阅读 ( 10790 )

如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章？

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生信老顽童
发布于 2018-06-20 10:18
阅读 ( 16746 )

利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息

相近功能基因的检索方法，如何利用pfam数据库下载隐马尔科夫hmm文件。

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landy
发布于 2018-04-23 14:05
阅读 ( 45145 )

ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看

参考基因组下载，Ensembl，NCBI，JGI等网站下载使用，可视化浏览,基因查看与下载等；

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omicsgene
发布于 2018-04-22 14:59
阅读 ( 36565 )

如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

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星莓
发布于 2024-01-11 14:09
阅读 ( 1824 )

送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！

APE是一款序列分析软件，可以对序列进行酶切位点预测、序列比对、引物设计、DNA序列翻译等等，用途是十分广泛，APE软件小巧快速，操作简单，下面我们一起了解一下它的功能！ 1. 酶切位点预测...

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红橙子
发布于 2020-06-29 11:58
阅读 ( 13602 )

Win10家庭版也可以装Docker桌面版了！

win10家庭版系统装docker桌面版的方法。

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生信老顽童
发布于 2020-04-28 08:32
阅读 ( 19368 )

ANNOVAR注释变异VCF结果说明

人类常见变异信息注释数据库结果

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omicsgene
发布于 2019-04-29 16:19
阅读 ( 13101 )

FigTree进化树批量修改ID

FigTree批量修改ID

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Daitoue
发布于 2019-01-17 09:41
阅读 ( 12004 )

Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件

Adobe Illustrator 无法加载次应用程序的本地化资源文件可以通过右键选择“管理员身份运行” 后能正常使用

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Daitoue
发布于 2018-10-29 09:27
阅读 ( 7057 )

blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明（blast+ m6格式）

blast 结果说明

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omicsgene
发布于 2018-10-19 12:06
阅读 ( 11947 )

bedtools求交集

bedtools求交集其用法： bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式，至少三列，分别...

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安生水
发布于 2018-10-19 11:30
阅读 ( 6520 )

iTOL绘制好看的系统发育树

系统发育树也称为系统发生树、聚类树或者进化树。它以树状结构表示各个节点的进化和亲缘关系，枝点可以是物种和基因等，在系统发育分析、基因家族和物种进化分析中经常会看到此类图片。

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安生水
发布于 2018-09-07 14:26
阅读 ( 24215 )

做韦恩图？自己搞定！

韦恩图又称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具，简单易学！

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安生水
发布于 2018-07-26 11:08
阅读 ( 25221 )

blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast，其比对结果一般都用m8格式（即参数是 -m 8，blast+是 -outfmt 6），但是结果文件中是没有表头的，这里来写一下。

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安生水
发布于 2018-07-20 11:13
阅读 ( 18290 )

python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

手把手教你多个基因组共线性作图。

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安生水
发布于 2018-07-12 17:14
阅读 ( 24815 )

MEGA构建进化树遇到报错信息

最近又有人遇到mega构建进化树时报错，所以分享一下这个经验给大家。 Oops!MEGA has encountered an error and cannot continue with this analysis:Some pairwise distances could not be estimated.For example,between sequences 23 and 11.

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omicsgene
发布于 2018-06-22 14:21
阅读 ( 33018 )

endnote 如何插入书籍引用

endnote引用书籍的章节。

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omicsgene
发布于 2018-06-22 13:43
阅读 ( 31896 )

MCScanX 安装报错，支持64位系统

今天有学员问 MCScanX 安装问题，我试了下，果然有错误。 make报错： g++ struct.cc mcscan.cc read_data.cc out_utils.cc dagchainer.cc msa.cc permutation.cc -o MCScanX msa.cc: In fun...