ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看
参考基因组下载，Ensembl，NCBI，JGI等网站下载使用，可视化浏览,基因查看与下载等；
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- omicsgene
- 发布于 2018-04-22 14:59
- 阅读 ( 44930 )
omicsgene
正选择分析之 Site Models
作为常用的正选择分析方法，计算Ka/Ks方法较为严格。本文介绍利用Sites Model方法来分析正选择基因。
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- 安生水
- 发布于 2018-04-22 10:39
- 阅读 ( 15640 )
安生水
火山云 | tos:// 数据下载 | windows/linux下载方式
01：windows | 通过 共享链接 登录 TOS Browser 软件（版本> v1.7.0）下载 01-1:在本地电脑下载TOS Browser 软件，安装包网址：https://www.volcengine.com/docs/6349/148777 01-2：双击...
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- rzx
- 发布于 2024-08-01 11:34
- 阅读 ( 4377 )
rzx
进化树美化操作详解- iTOL
绘制进化树，是科研人的基础技能之一，而一张好看的进化树图，不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系，更能增加文章的观赏性，赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...
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- rzx
- 发布于 2022-10-12 15:53
- 阅读 ( 25659 )
送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！
APE是一款序列分析软件，可以对序列进行酶切位点预测、序列比对、引物设计、DNA序列翻译等等，用途是十分广泛，APE软件小巧快速，操作简单，下面我们一起了解一下它的功能！ 1. 酶切位点预测...
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- 红橙子
- 发布于 2020-06-29 11:58
- 阅读 ( 17481 )
红橙子
生信老顽童
如何利用HMMER鉴定基因家族成员
作者 smyang2018 在可视化, 归档, 生物信息学, 软件学习 通常我们用的都是通过blast比对来确定我们需要的家族成员，首先是比对序列，再次是需要目标物种的蛋白序列，来进行比对，通常比对的时...
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- smyang2018
- 发布于 2019-04-04 10:23
- 阅读 ( 13975 )
smyang2018
GeneDoc绘制漂亮的多重序列比对图
由于软件的功能限制，一些比对软件生成的比对文件，如Clustalx的*.aln文件，可读性差，无法满足高质量期刊的要求。因此，在实际操作过程中，需要对一些多重序列比对的文件进行着色美化。 GeneD...
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- 安生水
- 发布于 2019-03-01 12:00
- 阅读 ( 23373 )
blast比对结果说明
我们作比对时经常用到blast，其比对结果一般都用m8格式（即参数是 -m 8，blast+是 -outfmt 6），但是结果文件中是没有表头的，这里来写一下。
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- 安生水
- 发布于 2018-07-20 11:13
- 阅读 ( 22655 )
你了解SAM和BAM文件吗
当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后，会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件！
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- 安生水
- 发布于 2018-06-29 09:33
- 阅读 ( 13043 )
如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧
PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章？
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- 生信老顽童
- 发布于 2018-06-20 10:18
- 阅读 ( 21854 )
利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息
相近功能基因的检索方法，如何利用pfam数据库下载隐马尔科夫hmm文件。
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- landy
- 发布于 2018-04-23 14:05
- 阅读 ( 54704 )
landy
PASA报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, asmbl_link.cdna_acc
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释，其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错： 把三代转录组数据投入PASA是出现报错：unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-09-30 13:50
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Ti Amo
cytoscape安装报错：No JVM could be found on your system
cytoscape安装报错：No JVM could be found on your system，通常是由于不适配的java版本
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-11-23 17:41
- 阅读 ( 2751 )
每天学习一点点
保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片
保姆式教程！手把手教你使用Simplot，绘制高大上的序列相似性图片
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- 生信阿姨
- 发布于 2023-01-31 15:30
- 阅读 ( 8864 )
生信阿姨
seqkit序列处理神器的常用命令
seqkit是一个序列处理神器，有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令，详细内容如下
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- 星莓
- 发布于 2022-11-18 17:22
- 阅读 ( 7417 )
星莓
