microRNA
ggplot2点图geom_point中aes(shape)映射
此前在相关文章中详细介绍了关于geom_point 在设定shape时可以进行多少设置，每种出现的结果： http://www.omicsclass.com/article/475 区别与点shape设定，点的shape 映射必须转化成因子，连...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-10-12 15:07
- 阅读 ( 6146 )
Daitoue
ggplot2点图geom_point中点的shape有多少？
ggplot2可以利用geom_point绘制散点图，而点的形状控制参数shape会显示多少效果呢？(注意此处只介绍shape的设定，不是aes(shape)映射） 可以通过查询?shape 获得以下内容： # Shape exampl...
- 0
- 1
- Daitoue
- 发布于 2018-09-30 16:59
- 阅读 ( 25331 )
ggplot2控制坐标轴截距交点位置（原点）
ggplot2绘图结果往往X轴和Y轴的交点往往不是原点：譬如下图y轴就不是起始于0 调整坐标起始位点可以利用scale_y_continuous(expand = c(0, 0))或者scale_x_continuous(expand = c(0, 0)) expa...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-09-21 17:05
- 阅读 ( 15854 )
ggplot2控制百分比坐标
在利用ggplot2绘图过程中常会要求Y轴显示为百分比类型，需要借助包scales 和ggplot2中的函数scale_y_continuous（labels）来控制 譬如绘制相关百分比或者密度频率等类型的图片时可以将对应的...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-09-21 15:58
- 阅读 ( 9293 )
ggplot2-气泡图（控制点的大小范围）
Pathway富集结果常用气泡图来显示，其基本代码如下： 案例数据： > dat ko_id Kegg_pathway Rich_factor Pvalue DEGs1 ko00195 ...
- 1
- 2
- Daitoue
- 发布于 2018-09-21 15:04
- 阅读 ( 19749 )
直方图---ggplot2（每组内添加对应的count 或者density文本标签）
利用ggplot2绘制直方图，基于几何对象geom_histogram()函数 geom_histogram(mapping = NULL, data = NULL, stat = "bin", position = "stack", ..., binwidth = NULL, bins = NULL, na.rm =...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-09-14 00:08
- 阅读 ( 15946 )
ggplot2图例位置legend.position调整
ggplot2绘图过程种，控制图例在图中的位置利用theme(legend.position）参数 该参数对应的设置如下： legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or...
- 0
- 1
- Daitoue
- 发布于 2018-09-13 18:19
- 阅读 ( 35256 )
Rstuido相关快捷键
部分Rstudio快捷键 Ctrl - o 打开文件 Ctrl - Shift - C 取消注释或注释当前选定区域 Ctrl - f 查找搜索 Ctrl - = 查找替换
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-09-09 19:58
- 阅读 ( 2075 )
ggplot2位置调整position
ggplot2 的geom()函数（几何对象）中常涉及图形元素的位置调整position，通过不同的参数调整可以使图片呈现不同的效果，主要的位置调整涉及如下方式： position 描述 dodge 避免重叠，并...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-09-07 15:11
- 阅读 ( 11336 )
饼图中添加文字的位置控制-ggplot2（非公式）
介绍不利用公式，而利用geom_bar(position)geom_text（postion)控制饼图文字的添加过程
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-09-05 13:25
- 阅读 ( 9560 )
ggplot2不同几何对象所能对应的图形属性
不同几何对应所能对应的图形属性设置，以及默认的统计变换形式。 表格如下： geom stat aes geom_abline abine colour,linetype,size geom_area identity colour,fill,linetype...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-31 15:03
- 阅读 ( 2965 )
ggplot2 笛卡尔坐标系x、y轴互换
利用ggplot2进行x、y坐标轴互换只需借助coord_flip()即可，譬如，以ggplot2绘图代码 http://www.omicsclass.com/article/92 为例，添加一个坐标互换函数，实现互换 library('ggplot2')libr...
- 1
- 1
- Daitoue
- 发布于 2018-08-24 13:40
- 阅读 ( 11442 )
ggplot2图片保存
R语言中可以将图片结果保存成pdf或者png，具体涉及两种方法： pdf()和png() 以ggplot2绘图结果： http://www.omicsclass.com/article/92 的图片保存为例 pdf(file = "p.pdf",width =1...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-23 11:42
- 阅读 ( 25613 )
ggplot2隐藏图例
这里简单介绍两个隐藏图例的方法 其一利用引导元素guides实现： 譬如借用www.omicsclass.com/article/92 分组柱状图代码： library('ggplot2')library('reshape2')A = c("A","B","C","D","E"...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-23 11:30
- 阅读 ( 19422 )
ggplot2几个主题类型
演示ggplot2几个默认的主题类型，直接套用对应的函数即可 数据参考 http://www.omicsclass.com/article/92 dat type Sample Num1 A sample1 902 B sample1 343 C sample1 ...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-17 16:33
- 阅读 ( 4094 )
饼图pie-ggplot2
绘制饼图的过程中，利用ggplot2的geom_bar结合coord_polar实现，需要理解的点是饼图的排布是按照aes(fill）的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat type Num1 A 902 B 343 C 56...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-17 14:28
- 阅读 ( 8537 )
安生水
堆叠柱状图-ggplot2
绘制堆叠柱状图，重点重点在于geom_bar中postion="stack"， 数据参考：http://www.omicsclass.com/article/92 dat type Sample Num1 A sample1 902 B sample1 343 C sample1...
- 0
- 2
- Daitoue
- 发布于 2018-08-17 10:12
- 阅读 ( 14350 )
R 语言colors()657种颜色
R进行绘图多会涉及颜色搭配问题，利用colors()可以获得R种的657种颜色名称。 head(colors(),20) [1] "white" "aliceblue" "antiquewhite" "antiquewhite1" [5] "antiquewhite2" "...
- 0
- 0
- Daitoue
- 发布于 2018-08-10 14:29
- 阅读 ( 13272 )
