Rstudio 防止中文乱码(保存与显示)

为了防止代码文件出现中文乱码,一般在Rstudio中,都要求将文件保存为UTF-8格式,同时打开显示也要求以UTF-8格式进行显示,相应的设置方法如下: 保存文件: 进入Tools——Global Options,选...

  • 0
  • 3
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-17 11:57
  • 阅读 ( 16489 )

删除向量中指定的元素(借助向量中元素索引)

在进行数据处理的过程中,可能会要求删除向量中某个指定的元素,这一操作可以利用R 语言向量中每个元素都对应一个索引完成,而获取索引下标可以利用which(),而match()只会返向量中第一次出现的...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-16 18:05
  • 阅读 ( 9111 )

创建有序因子

利用factor() 或者ordered() 两个函数将普通变量转换成有序因子。

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-13 17:29
  • 阅读 ( 1669 )

ggplot2 绘图 离散型颜色选择 ColorBrewer

利用ggplot2绘图 scale_fill_brewer() 或者scale_color_brewer() 会使用到ColorBrewer 配色。可以利用相关的命令查看改配色方案。 library(ggplot2)RColorBrewer::display.brewer.all() 通...

  • 0
  • 1
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-13 16:53
  • 阅读 ( 4462 )

GEOquery 读取本地表达矩阵压缩包

利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中: 矩阵文件的基本命名格式...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 16:00
  • 阅读 ( 8040 )

R语言绘制维恩图空值NA处理

行数不同的数据读入R,批量去除NA,绘制韦恩图。

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 16:16
  • 阅读 ( 7218 )

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-04 12:02
  • 阅读 ( 8338 )

统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

R统计不同差异组合,上下调基因个数;并用ggplot2绘制柱状图。

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-03 14:02
  • 阅读 ( 9806 )

R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

统计相同ID出现的频率,并用ggplot绘制柱状图;

  • 1
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:46
  • 阅读 ( 8265 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制柱状图

R语言,按数值范围统计频次,绘制柱状图

  • 3
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:33
  • 阅读 ( 8013 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制饼图

按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;

  • 1
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:22
  • 阅读 ( 7557 )

R处理大数据时内存out of memory的问题

R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题,相关解决方法: 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况(MB) 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-29 13:16
  • 阅读 ( 2969 )

R 删除重复数据

R 删除重复数据的方法,包括duplicated 和unique 针对duplicated, 对向量的元素或数据框的行进行操作的时候,返回逻辑值,以下面的数据框为例:  dat   A B C D1  a b a c2  c k b d3  c k c c4...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-27 22:00
  • 阅读 ( 3671 )

Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

系统聚类Hierarchical clustering(层次聚类、谱系聚类)— 最短距离法(single linkage)— 最长距离法 (complete linkage)— 中间距离法 (median method)— 可变距离法 (flexible median)— 重心...

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 12:11
  • 阅读 ( 5382 )

ggplot2几何设置——geom

列举ggplot2的geom设置内容,方便查找绘图对应方法

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-22 09:59
  • 阅读 ( 4382 )

readxl包读取excel的多个函数简介

readxl包括多个可以读取excel的函数,比之xlsx包更方便

  • 0
  • 1
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 16:09
  • 阅读 ( 6287 )

火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:59
  • 阅读 ( 6191 )

melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理,改变数据组合方式

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:30
  • 阅读 ( 2263 )

绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 12:06
  • 阅读 ( 4899 )

如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

AnnotationDbi 和 结合物种对应的注释文件,将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)

  • 2
  • 4
  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-07 18:30
  • 阅读 ( 33133 )