python版mcscan - 组学大讲堂问答社区

python版mcscan

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已知目标基因，如何进行局部共线性绘图？

在日常的生信分析中，通过一些组学分析策略我们能够得到与某一物种性状紧密关联的候选基因。在此情况下，如果我们想要对候选基因在其他物种中的同源基因进行查找，或者在染色体上对这些基因进行定位，那么就需要进行物种间基因座的局部共线性可视化(Microsynteny visualization)。今天我们就来教大家使用jcvi软件包中的子程序MCscan(Python version)进行物种间基因组的局部共线性绘图。

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每天学习一点点发布于 2023-09-14 11:29

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jcvi微共线区域(Microsynteny)可视化

如何使用jcvi通过调整相关文件参数展示局部共线性情况

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每天学习一点点发布于 2023-08-15 18:06

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python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 3 values to unpack

python 版本的mcscan 绘图输出报错， need more than 3 values to unpack

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omicsgene 发布于 2022-04-11 15:48

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canda 安装的jcvi 遇到字体错误： UserWarning: findfont: Font family [u'sans-serif'] not found. Falling back to DejaVu Sans (prop.get_family(), self.defaultFamily[fontext]))

canda 安装的jvvi 遇到字体错误：

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omicsgene 发布于 2020-04-08 12:41

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AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color'

python mcscan 运行报错

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omicsgene 发布于 2018-11-17 20:39