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R语言下载GSE数据的问题

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5 如何利用perl脚本批量提取多个物种的CDS

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5 bio-linux无法下载。

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特异分泌蛋白的鉴定

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5 TCGA中miRNA可以区分5P和3P么？

  • 2019-01-04 12:11
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5 在virtual box里面导入Bio-linux时出现了错误，是怎么回事啊

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安装clusterProfiler时，按照正常source("http://bioconductor.org/biocLite.R")，biocLite("clusterProfiler")，结果出现下面问题是怎么回事呢？请老师帮忙解答，谢谢！

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5 请问大家怎么找相关包或工具的原始文献？比如我要找edger包、Tagetsscan、kegg、go等的文献出处。通过百度可以找到一些相关的文献，但不确定，所以咨询下各位老师！

  • wu 2019-01-03 22:48
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麻烦老师解答一下

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老师，我在用比较基因组学方法做两个物种之间的共线性分析时，是可以筛到某一种基因家族在两个物种中对应的共线性的，但是用下面这种方法做是做不出来某一基因家族在两物种之间的共线性关系的

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如何提取biotype_classs.txt

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5 gtf_extra_biotype.pl biotype_classs.txt 的代码

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perl脚本运行

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进化树构建

  • 2019-01-03 10:38
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你好，我用circos画共线性图，基因离太近只能显示一个，我该怎么设置才能让都显示出来呢

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5 怎么下载ICGC数据库里，某个基因的所有的突变数据

1 解决

计算KaKs时，axt文件中两序列长度一致，但是仍然提示“not equal”（详情见下图）

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计算串联重复基因的KA/KS出现以下问题

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5 TCGA数据下载的时侯要有biotype_classs.txt

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老师，我在看菠萝的WRKY基因家族分析时，在看到基因组间共线性分析时有个词orthologous pairs不懂是指啥意思，原本我以为指的是红线菠萝WRKY基因家族，但是貌似不是这样的，请老师指点迷津