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老师,我发现课上的热图代码所制的热图会把行和列的数据都发生重排,这样看热图规律有点乱,有没有办法不让列的样品重排呢?或者行列都不要重排?麻烦您,谢谢老师。
R热图绘制
Bella
2018-11-22 15:11
2
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老师,我的文本矩阵中已经全部是数值型数据了,没有NA的形式,在运行简单热图代码pheatmap(ORFs)时可以成功;但是在标准化后在运行热图代码pheatmap(ORFs,scale = "row")时就显示了和之前同样的下列错误,这是为什么呢?麻烦老师,多谢啦。
R语言绘制热图
NA/NaN/Inf
Bella
2018-11-21 23:22
1
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MEME网站分析蛋白结果要怎么看motif,查文献看该motif的偏好结合元件
meme
咕噜咕噜叫
2018-11-21 19:45
1
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5
获取virtualbox com对象失败
biolinux
虚拟机
2018-11-20 18:12
1
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预测基因家族成员的顺式作用元件,提取启动子序列失败
启动子序列提取
基因家族分析
Maggie
2018-11-20 15:25
2
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5602
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在做WGCNA分析时,已经找到最相关的模块,想要用其中的lncRNA和基因根据pearson's correlation coefficients做一个热图(行为lncRNA,列为基因),但是根据 课程的代码并没有看见这部分计算的结果在哪里,不知道这个pearson's correlation coefficients如何计算?谢谢~
WGCNA
张婷婷
2018-11-20 10:36
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老师,我绘制热图时运行结果显示这样,这是什么问题呢,麻烦老师,多谢啦
热图输出结果
NA/NaN/Inf
Bella
2018-11-20 10:05
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5
求大神指导如何安装Bio-linux系统,及在该系统下如何安装CG View及Orthmcl和OrthoFinder
CG View及Orthmcl和OrthoFinder
Bio-Linux
Poppy
2018-11-19 22:33
1
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Mev使用过程中出现问题
热图
MeV
毛栗小懒彤
2018-11-19 20:08
1
解决
4069
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聚类分组后,怎么针对各分组再进行分析
序列提取,功能富集
Melody
2018-11-19 19:11
2
回答
14762
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5
基因家族分析中基因家族成员的筛选与取舍如何判断?
基因家族分析
Sunny
2018-11-19 15:19
2
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3741
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老师,请问热图重排序列读出来这儿表格列名为什么会整体偏移一格?
R热图基因重排序列读出
Bella
2018-11-19 13:52
2
回答
4806
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已知一个蛋白质,想要通过生物信息学方法找与他相互作用的lncRNA
致虚静笃
2018-11-18 18:19
1
回答
3571
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5
基因家族分成了几个亚族,有人写了其中的一个,我能不能挑一个没写的写一下,还是因为没写的是人家剔除不要的
Milan Shepherd
2018-11-18 11:58
1
解决
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5
基因上游顺势作用原件分析
2018-11-17 12:14
1
解决
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5
关于BSA取样的问题
BSA
2018-11-16 17:48
1
解决
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5
在基因家族分析的基因结构分析时,运行脚本得到的文件内容,到gsds中显示解析错误,而且文件和demo中的不一样
Milan Shepherd
2018-11-15 21:26
1
回答
4470
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5
做WGCNA分析时,modules数量多少时结果较为理想?
WGCNA
2018-11-15 20:38
2
回答
17006
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5
为什么基因表达量进行标准化之后会有负值
标准化
microRNA
2018-11-15 14:31
1
解决
5246
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python_mcscan,error-OSError: [Errno 2] No such file or directory: 'kpsewhich'
MCScanX
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2018-11-15 09:52
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