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5 关于paml包里的codeml 程序计算的问题

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老师 gff3文件第三列应该显示gene cds exon等符号处 没有gene符号 最后找到的文件也是空的 怎么办

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5 提取基因序列

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请问对比基因在染色体位置下载第三个dna文件里面的哪个fa.gz文件

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找基因在染色体上的位置 用的是cdna.fa还是dna.fa

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老师 找基因在染色体上的位置 用的是cdna.fa还是dna.fa

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无参转录组GO和KEGG富集分析如何实现

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老师，您好，我用circos做基因家族共线性的时候，因为两个基因名位置太近，所以只能显示一个，然后我加了叠加命令，能显示距离太近的基因了，但是发现有很多基因总是有3-4个的重复，我只想展示一个就行，请问怎么解决这个问题

  • 2018-12-19 12:18
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5 基因提取

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我做circos图的时候发现因为两个基因距离太近因此没法显示全，只显示一个，请问我除了视频教学的方法手动添加还有别的办法吗，我想通过调config的参数来达到这个目的，但是不知道怎么调

  • 2018-12-18 23:02
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绘制转录本图，无法提取文件

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转录组数据怎样根据差异结果筛选重要候选基因;挑选重要的KEGG通路；是根据自己对材料的认识，或是生理表型结合表达数据，如有方向的猜测？

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5 GEO数据的下载（利用GEOquery包下载)

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老师，麻烦您帮我看一下我在做共线性分析时用到vlookup, 方法跟您的一样，就是筛不出来

2 解决

5 麻烦求助，在使用ncbi_gff_2_Ensembl_gff.pl这个脚本的时出现报错显示：cant find the string terminator "Usage end"...in line 10

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5 下载的gff注释文件中没有 两端 UTR信息，有没有批量识别UTR的工具或者网站？

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5 老师，我想问一下，我在预测顺式作用元件时，在提取出来的基因上游1500bp的文件中，有的基因是这样的

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5 用ncbi搜索pfam号 为什么没有 出来的是pmid 怎么办 文章也没有pfam号

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5 打开虚拟机出现unwritten 老师这怎么解决呀

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5 老师，我在两个基因组间的共线性分析时，在excel中用到vlookup时，出现了跟您在课程里实操分析时数据筛选时，只出现了#N/A，不知道是什么原因