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CoNet构建OTUs网络图，一直报错！

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老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错，请问您知道大概有什么原因吗？

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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 21:00
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5 疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 20:37
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Cytoscape的CoNet插件相关性阈值的设定

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10 如何批量根据微生物种属名称下载某一功能蛋白的氨基酸或核酸序列？

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结构方程模型中细菌或真菌群落组成表示

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你好老师有关网络图绘制的问题

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关于绘制OTU与环境因子互作的网络图

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宏病毒组得到的contig如何做系统发育分析，包括如何选取合适的序列？contig是否需要截取相应的基因片段？如何截取？

  • 2019-10-22 13:47
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老师，您好，在学习样品与OTU二分网络图的绘制中，导入Cytoscape中的文件ewight值是如何计算的？

  • 2019-10-07 13:29
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老师您好！请问一个处理只有5重复，能用这5个重复在MENA中做16S网络图分析吗（相当于MENA分析的样本量为5）？MENA网络图分析对样本量的要求是多少呢？

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5 你好 我现在在用cytoscape的conet做共现网络分析图，去掉世系之后确实是可以运行正常的，但是我做的图是需要世系的，因为需要标出图例，表明是在门分类下 具体是哪种微生物，请问我要怎么去调整taxonomy的数据格式才能使得conet不报错

  • 2019-07-31 11:12
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5 老师，您好，我在MENA上传示例数据时候，总是出现错误，这是网站的原因吗？

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5 大家好，我第一次注册分子生态网络MENA账号是总是提示邮箱和账号已被用，试了好几次都不行，请求各位大神指点迷津

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用qiime识别16S测序结果的嵌合体（chimera）要多久？为什么等好久没反应，输入命令都变成乱码？

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5 请问用cytoscape进行conet网络构建时原始数据文件是怎么得来的

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比较基因组绘图时报错

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原核转录组和真核转录组建库有什么不同？

1 解决

测定植物内生真菌时需要注意什么？测多少数据量合适？

  • 2018-09-06 22:16