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在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误，

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lefse分析细节

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想咨询一下老师，这个图大概是咋做出来的，应该用到什么样格式的数据，在网上没搜到教程，主要是需要什么数据，谢谢老师

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老师这个示例文件夹里没有东西，我cd到01.prepare_data文件夹下里面时候空的

  • Oho 2025-03-09 11:43
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老师 请问这个运行时需要很久吗，上面显示的需要7天

  • Oho 2025-03-08 15:13
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老师我在解压eggnog.db.gz文件时显示失败

  • Oho 2025-03-08 09:57
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宏基因组基因定量salmon

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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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请问可以同时运行2个terminal吗，在内存和存储还有cpu都有剩余很多的情况下

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请问这2个sam文件对后续有什么帮助吗 占用内存太大 想删掉 不知道有没有用

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想咨询一下，我有1批宏基因组数据，可不可以样本对半，分成2次进行

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CAZy注释阶段，hmmer的太慢占用cpu只有一直很少

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想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

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请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度，有什么教程吗

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宏基因组分析，用来分组的metadata格式具体是什么？

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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

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binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？