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RNA-seq分析，测序数据比对到基因组上，hisat2 报错

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WGCNA邻接矩阵转化成拓扑重叠矩阵时出现异常

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linux（虚拟机） 安装Aspera的方法？

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老师你好，我是在NCBI上面下载的枣的gff，以及蛋白质序列，做共线性分析的时候，perl get_gene_position.pl GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_genomic.gff AT.gff输出之后的文件与perl get_fa_by_id.pl AT1.gff GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_protein.faa pep.fa输出的文件是空的，应该怎么办。

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老师，您好，我在将windows中的共享文件夹，挂载到linux系统的共享文件夹目录的时候，显示错误信息/sbin/mount.vboxsf:mounting failed with the error:No such device。麻烦问一下，应该怎么解决，谢谢啦！

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10 关于Cytoscape绘图，如何将酶基因之间的关系画出来

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WGCNA样本聚类报错

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10 请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）研究某一家族基因的案例吗？

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请问老师，进化树中original和bootstrap树有什么不同，同源性最大的一个基因应该怎么看，两次用相同基因做进化，为什么距离最近的是不同的基因

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老师您好，在bio-Linux中，sed命令出现以下错误，想请问老师，这种情况应该怎么解决？谢谢

  • 2020-06-01 17:00
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老师，您好，能不能把miRNA与靶基因相关性Correlation_analysis.pl的脚本给一份？

  • 2020-06-01 16:05
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虚拟机导入成功，但是设置的时候出现问题，发现无效设置，OK键也不反应

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perl老师你好！可以发一下perl的安装包么？在网上下载一直下不下来！后续工作没法做了

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目前我感兴趣的植物基因(全基因组测序未完成），仅仅在NCBI上公布了mRNA序列，大概有80个。请问可以进行基因家族生物信息学分析吗？

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RNA-seq分析，用index.sh建立索引exons.tsv文件为空

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5 老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？

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黄老师，我已获得BSA流程过滤后的snp的vcf文件，然后怎么利用这个文件绘制全部染色体的SNP-index的曼哈顿图

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老师您好，我在做物种间基因组共线性分析时没有得到.anchors文件并且出现list index out of range报错,请问一下是什么原因？

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我想请教一个问题，如果没有GFF文件，能从基因组中进行基因序列提取吗？批量的那种？ 另外，方便的话可否推荐一个提取序列好用的软件，感谢！

  • 2020-05-28 21:29
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老师，请问基因家族数量太多，如何确定其中的假基因，是否可以每个基因选择一个转录本来构建进化树呢