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10 老师，我在做甘蔗基因家族分析，发现hmmsearch完了之后得到的序列与传统的名称不太一样，因为他染色体命名好像是1A2A3A4A,1B2B3B4B这样的

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kegg注释问题

  • 2020-06-28 16:43
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老师，请问sample type出现这种情况怎么解决，麻烦老师解惑一下，谢谢啦。

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下载甲基化数据时找不到样本类型，

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pheatmap做cutree,分成了4组，怎样知道每组中都有谁，每组有多少个基因呢?我数据量比较大，不能全部显示

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NCBI序列上传

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怎么用公用数据库收集某种疾病相关的蛋白质质谱数据集

  • 2020-06-26 20:44
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isoseq3 流程问题

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RNAseq有参转录组数据自主分析课程，在建立基因组索引的时候出现如下问题

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老师你好，解压编译好的软件在执行时提示说：无法执行二进制文件，这是怎么回事我又该如何解决呢？

  • Xzq 2020-06-26 13:01
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最近用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错，看您留言说已经解决了，请问您是怎么解决的呢？望您解惑，谢谢。

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老师，在用lumi包提取未标准化的表达矩阵的时候为什么会报错呢？下标出界。下载的文件没有跟教程一样的表头

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Anaconda 配置镜像后，安装软件总出现这个界面，请问该怎么解决？

  • 2020-06-24 15:51
2 解决

20 今天python版本的MCscanX在用于比较基因组学分析时突然出了问题

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大牛好，我用conda安装了perl之后，然后调用perl的时候报错说我缺少Bio：：Sioq这个模块，请问接下来该如何用conda安装perl模块呢？还是只能用其他方式安装，那又该如何将这个模块和conda安装的perl联系起来呢？求解

  • Xzq 2020-06-22 21:11
2 解决

60 果实发育时期的转录组热图中，有几个基因在各个时期均表现低FPKM值，请问是转录组数据有误吗？

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mapman里边如何确定要研究的通路？例如我想看内质网中的蛋白质加工，但是mapman里边没有，这要怎么办？？？？蟹蟹

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mapman里边如何确定要研究的通路？例如我想看内质网中的蛋白质加工，但是mapman里边没有，这要怎么办？？？？蟹蟹

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一个基因，在实验组fpkm大于1，对照组fpkm小于1,有人说fpkm大于1，为有效表达，我可以把小于1的默认为等于0吗？然后做差异分析

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请问HMM搜索，对于无蛋白文件的基因组，可以对实验室自有的转录组序列或数据做筛选吗？