5 各位老师好,我买了你家的基因家族的课程,我咨询一下几个问题:(1)我分析NBS-LRR基因家族,其中CC结构域没有hmm文件,你们分享的文献中说用Paircoin2软件,我想问一下,这个软件怎么使用;(2)我用figtree美化进化树,为什么树枝上的Bootstrp是小数,而不是MEGA建树中的整数。

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2 个回答

生信老顽童

1、没有hmm文件的话,用blast比对的方法来鉴定。在课程里有讲的,仔细看看视频吧
2、我们课程讲的是使用mega,figtree我用的不多。建议你按照课程里讲的操作。

课程:https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

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张毅

没有hmm模型的话可以用利用hmm软件含有cc结构域的序列构建一个模型cc


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  • 小强 提出于 2020-11-05 15:33

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