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mcscanx分析 family_circle_plotter 绘图时生成的图片残缺

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共线性分析与kaks计算

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进化树分组与预期不符

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clustalw2多序列比对，序列输入不进去

  • 2020-01-09 14:35
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在提取1500bp序列做顺式作用元件检测时，使用tiquxulie.pl这个脚本，开始时显示out of memory，我把虚拟内存提高到了4G，显示zsh：killed,得到的结果还是空的，请问老师这个问题怎么解决呢？

  • dec. 2020-01-09 00:43
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请教！基因结构分析出现这样的问题如何解决？

2 解决

20 请教用gtf文件获取基因与mRNA的对应关系的问题

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比较基因组学构图（物种间共线性分析）时，anchors生成时，内容为空，但是其他的文件有内容。

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比较基因组学构图（物种间共线性分析时），手动生成两个配置文件时，再运行linux系统中的python绘图时出现这个问题，不知道是不是配置文件出现问题，我检查了bed文件的染色体命名时，没发现什么问题。ZeroDivisionError: float division by zero

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你好，老师。同一个基因用视频流程获取的启动子序列2kp，是mRNA前面的2kp，不是CDS区前的2kb.现在提取的启动子都是CDS区前的2kb啊，mRNA与CDS区的注释长度不同，就导致我们获得启动子区域不正确

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mega构树

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如何手动将aln转成axt？

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加倍分析时没有一条红色线，正常吗

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基因的收缩与扩张

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kaks计算过程问题

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做共线性分析时，作图时输入程序后总是会出现下列现象，是怎么回事？

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共线性mcscanX绘制圈图

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共线性 ZeroDivisionError: float division by zero

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5 基因家族分析时，顺式作用元件提取只能提取列表中的一部分基因，请问是什么原因

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MCsanX运行报错ZeroDivisionError: float division by zero