群体遗传进化分析用MEGA

MEGA进行遗传进化分析,揭示不同种群间遗传进化关系和环境适应性机制。

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-23 09:39
  • 阅读 ( 12754 )

Linux生物信息分析环境搭建

想做生物信息分析,但不知道怎么入门?先来搭个环境吧!想分析数据,但是分析不了?先来搭个环境啊!搭建好环境,后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows,而很少使用Linux,然而做...

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2018-04-22 23:08
  • 阅读 ( 3857 )

转录组如何与其他实验手段结合?(第二篇文献)

同一个转录组数据多篇文章,转录组如何结合其他实验手段!好文难得!

  • 2
  • 0
  • 红橙子
  • 发布于 2018-04-22 22:49
  • 阅读 ( 3023 )

转录组+sRNA+降解组=7分文章

三种测序数据进行联合分析,以期揭示东南景天在Cd胁迫下的植物修复过程中的调控网络

  • 1
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 22:12
  • 阅读 ( 5218 )

PBJ:转录组揭示植物中磷再转运的分子机制

只要找对了研究方向,做好充分的调研准备,即便是常规的实验技术,一样能够发高分文章。

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 22:00
  • 阅读 ( 3644 )

茶树在非生物胁迫下的转录响应

非生物胁迫下耐受性植物 转录组实验的典型研究思路。

  • 0
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 21:49
  • 阅读 ( 2997 )

RNA-seq发文必备技能——GEO数据库上传

使用转录组数据发文章必备技能——教你轻松搞定GEO数据上传。

  • 1
  • 0
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 21:44
  • 阅读 ( 11055 )

OTU互作网络分析用MENA

MENA,一个可以利用OTU数据进行在线分子生态网络分析的网站,帮你搞定OTU互作网络图。

  • 1
  • 2
  • Daitoue
  • 发布于 2018-04-22 21:19
  • 阅读 ( 17991 )

获取MOTIF 位置信息矢量图

MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解,是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具,结果输出一般是有四个文件,motif的图形展示文件(LOGO),txt文本,html的网页信息文件及xml...

  • 5
  • 2
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 21:05
  • 阅读 ( 14755 )

两分钟看懂基因组注释GFF文件

随着大数据时代的到来,很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候,会用到一个很重要的文件,就是基因组的注释文件,也就是今天分享内容的主角GFF文件! 什么是GFF文件...

  • 5
  • 2
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 21:00
  • 阅读 ( 23330 )

做进化树,到底哪种算法适合我?

进化树(英语:phylogenetic tree)又称演化树(evolutionary tree),是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树状图。是一种亲缘分支分类方法(cladogram)。在图中,每个节点代表其...

  • 1
  • 0
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 20:56
  • 阅读 ( 4748 )

一键搞定批量序列提取TBtools!

用基因ID提取其序列很简单,ctrl+F找到ID对应的序列,ctrl+C、ctrl+V就好了,少量基因的还OK,但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽? 这里墙裂推荐一个软件,功能很强大,就是TBtoo...

  • 5
  • 8
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 19:08
  • 阅读 ( 28300 )

分分钟教你绘制基因结构图!GSDS

今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server,简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构,清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制...

  • 9
  • 13
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 18:59
  • 阅读 ( 58145 )

两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!

使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行,所以使用前记得要安装JAVA。  第一步:选择合适的树形 使用File – open 打开树文件(一般为.nwk文件),在左上方绿色...

  • 8
  • 3
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 18:38
  • 阅读 ( 26659 )

病毒衍生的small RNAs: 宿主与病毒互作的分子“证据”

    病毒是专性寄生,需要借助宿主才能进行复制,繁殖。在病毒的复制循环过程中,其RNA中间体可以被宿主的不同抗病毒途径RNA decay、RNA interference、 and RNase L pathways识别并降解,从而...

  • 0
  • 0
  • landy
  • 发布于 2018-04-22 18:12
  • 阅读 ( 2752 )

4个样品重测序发PlosOne

4个甜瓜重测序绘制抗白粉变异图谱[1]发PLoS ONE

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 15:04
  • 阅读 ( 2384 )

性价比超高5个重测序发IF=6遗传进化文章

混池测序做遗传进化,分析受选择基因

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 15:02
  • 阅读 ( 2913 )

ensembl和NCBI基因组下载,基因序列下载查看

参考基因组下载,Ensembl,NCBI,JGI等网站下载使用,可视化浏览,基因查看与下载等;

  • 8
  • 4
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:59
  • 阅读 ( 36689 )

低成本转录组跨种遗传进化分析

金蕨属转录组遗传进化分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:52
  • 阅读 ( 4309 )

为什么做生物信息分析需要学会linux

Linux系统生物信息分析必备利器。

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2018-04-22 14:48
  • 阅读 ( 9505 )