sort 按照染色体排序后按位置坐标排序

经常会遇到对bed文件或其他相关数据的排序,记录一下如何先按照染色体号排序,然后按照坐标位置排序。 sort -k1,1 -k2n file1 > file2 排序完成后如下:

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  • 星莓
  • 发布于 2022-10-24 09:55
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r绘图0不在原点的问题

使用plot画图的时候,只是设定xy轴范围仍然在0之前会有一小段多出来的范围 例如:plot(runif(10,0,10),type="l",xlim=c(0,10),ylim=c(0,10)) 使用:xaxs/yaxs="i" 代码即可解决 例如:plot(r...

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  • xun
  • 发布于 2022-10-21 17:29
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pfam 隐马尔可夫模型序列最新下载方法

HMMER 隐马尔可夫模型序列最新下载方法

GeMoMa-1.9.jar 报错mbol: g_settings_backend_get_type

mbol: g_settings_backend_get_type

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-10-19 15:19
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notepad++显示所有字符(隐藏的回车换行空格)转换CRLF

notepad++显示所有字符(隐藏的回车换行空格)转换CRLF

用R语言快速合并大量表格文件

合并文件

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  • 发布于 2022-10-14 10:33
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linux删除某用户下所有的进程命令

1. ps列出用户的pid,然后依次kill掉,比较繁琐 kill -9 `ps -uf username |awk '{ print $2 }'|grep -v PID` 或 ps -ef | grep username | awk '{ print $2 }' | xargs kill -9 2. pkill方...

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  • 星莓
  • 发布于 2022-10-14 10:21
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awk统计文件某列中某关键词出现次数

有时我们需要统计文件的某列中某些词出现的次数,可以在Linux下使用sort | uniq -c,那用awk怎么操作呢?

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  • 星莓
  • 发布于 2022-10-12 18:29
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进化树美化操作详解- iTOL

绘制进化树,是科研人的基础技能之一,而一张好看的进化树图,不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系,更能增加文章的观赏性,赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...

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  • rzx
  • 发布于 2022-10-12 15:53
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AI保存PNG/PDF/JPG时“出现了未知错误”的解决办法

AI保存PNG/PDF/JPG时“出现了未知错误”的解决办法

关于CodeML分析中Branch-Site模型假设

branch-site models 类似于branch model和site model的合集,主要假设基因的不同位点间(site)和系统发育树的不同分支间(branch)的ω值均是变化的,目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...

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  • rzx
  • 发布于 2022-10-10 17:12
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关于CodeML分析中四种常见模型假设

codeml是PAML软件包下的一个程序,在估算蛋白编码序列同义替换和非同义替换速率以及检测序列是否经受正选择分析中受到广泛应用。 对于一棵系统发育进化树,在考虑其不同序列间(site)和不同支...

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  • rzx
  • 发布于 2022-10-10 15:41
  • 阅读 ( 4281 )

linux将一个文件复制到多个文件夹

cp命令可以简单的将多个路径的文件复制到一个文件夹内,但反过来就会麻烦很多 不过和其他命令搭配也可以实现 echo 路径1 路径2|xargs -n 1 cp -v 需要复制的文件 当然,路径可以一直加,也可...

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  • xun
  • 发布于 2022-10-09 09:33
  • 阅读 ( 2079 )

Linux下判断数值大小

Linux下判断数值大小

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  • 安生水
  • 发布于 2022-09-29 10:57
  • 阅读 ( 1584 )

U盘安装 CentOS 注意问题

U盘安装 CentOS 注意问题

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  • 发布于 2022-09-28 17:18
  • 阅读 ( 2902 )

mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

解决老牌植物软件mapman出图的bincode与图上的binname不匹配

区分cds utr.exon

区分cds utr.exon

braker软件运行报错

braker

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  • 安生水
  • 发布于 2022-09-23 11:35
  • 阅读 ( 1762 )

多款软件进行vcf合并--gatk、vcftools、bcftools

链接:https://www.jianshu.com/p/116c8e4c93f4

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  • 星莓
  • 发布于 2022-09-21 18:00
  • 阅读 ( 8315 )

blast+在linux上的用法

blast+在linux上的用法