MNP标记设计中DP的计算方法

MNP标记设计中DP的算法

MNP标记设计中多态性窗口的筛选标准为DP指标: DP= t / c ( N ,2),其中c ( N ,2) 是N 个品种中任意两种的品种组合对数, t是每对品种在窗口内至少有两个分散的 SNP 的数量。

如下所示:

假如有3个品种,1个窗口内有3个SNP。其中品种1与品种2有两个SNP的基因型不同,记为1;品种1与品种3也有两个SNP的基因型不同,记为1;品种2与品种3只有1个SNP的基因型不同,不计数。所以 t 的数量就是2。


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  • 发表于 2023-05-08 16:34
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安生水
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