下面就给大家介绍两篇利用WGCNA分析基因共表达网络来提升文章档次。
简便好用的序列提取的perl脚本
1、第一步先将软件添加到路径中 2、第二步,win+r,输入cmd,此处以QQ为例 下次直接打开这个就行了,不用点其他的了 3、在win+r界面可以经常使用小软件,如,calc等等。。。。
python学习2
1:、数值类型 整型、浮点型、布尔型、复数型 整型:1;2 浮点型:a=1.1;b=2.3 布尔型:True;False 复数型:e=1+1j 2、查看类型 令a=1 dir(a) 3、查看数据类型 4、a+=1等于a=a+1 a-=1...
linux常用命令 1:创建文件和和文件 mkdir+yangsm#表示 创建一个yangsm的一个文件夹 vim+yangsm.txt#表示创建一个yangsm.txt的一个文件 2:在vim文件中如何退出 a、Esc b、ctrl+;#可以加...
推荐一个Mapman 本体查询的网站:GoMapman(http://www.gomapman.org/) 网站主要涉及了蛋白、代谢物以及sRNA在Mapman注释通路的查询。通过完整可以浏览具体的通路上可能会涉及那些基因,也可...
韦恩图又称文氏图,是科研文章中最常见的图,可以用来表示多个数据集之间的大致关系。小编来介绍几种常用在线绘制韦恩图的工具,简单易学!
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借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...
搜索鉴定基因的保守结构域,应该用专门搜索基因的保守结构域工具CD-search,而不是简单的用blast搜索注释。快速找到这个基因上的保守结构域,对研究基因的功能是非常重要的,因为行驶相同相近功能的基因往往具有相同的保守结构域!
2018年最新利用TCGA/GEO数据库挖掘文章列表
perl中的正则表达式
GFF3格式说明
MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。
我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。
TCGA 数据的多组学WGCNA联合分析
clusterProfiler做非模式物种的功能注释
你可以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做...
如何鉴定测序文库是不是链特异性