bedtools安装报错cc1plus: error: unrecognized command line option "-std=c++11"

bedtools 安装报错

最新版本bedtools 下载地址:https://github.com/arq5x/bedtools2/releases

安装方法:https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/installation.html

$ wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.25.0/bedtools-2.25.0.tar.gz
$ tar -zxvf bedtools-2.25.0.tar.gz
$ cd bedtools2
$ make


源码安装,直接make,会报错如下:我的gcc版本:gcc version 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-17) (GCC),

CURRENT_VERSION  =
Updating version file.
 * Creating BamTools API
- Building in src/utils/FileRecordTools
  * compiling FileRecordMgr.cpp
cc1plus: error: unrecognized command line option "-std=c++11"
make[1]: *** [../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1
make: *** [src/utils/FileRecordTools] Error 2
这是因为gcc版本太低,提高版本,make顺利通过:

export PATH=/share/work/biosoft/gcc/gcc-v4.8.0/bin/:$PATH
  • 发表于 2018-09-29 10:56
  • 阅读 ( 4002 )
  • 分类:软件工具

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