软件工具 - 文章 - 第9页 - 组学大讲堂问答社区

NCBI下载SRR并转换为fastq文件

想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考

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星莓
发布于 2022-12-09 11:56
阅读 ( 13048 )

pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...

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xun
发布于 2022-12-05 16:42
阅读 ( 3309 )

mysql启动时报错：error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file

mysql启动时报错

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安生水
发布于 2022-12-05 14:14
阅读 ( 2234 )

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000)

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安生水
发布于 2022-12-05 14:09
阅读 ( 2934 )

interpro 查询结构域

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生信阿姨
发布于 2022-12-01 13:14
阅读 ( 4610 )

uniref50 数据库下载及格式化

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omicsgene
发布于 2022-11-29 10:42
阅读 ( 2595 )

singularity运行fastqc报错OutOfMemoryError

比如在singularity中运行： singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc 可能报错：可以加一个-t选项，多线程运行，如下图，...

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生信老顽童
发布于 2022-11-25 13:16
阅读 ( 1576 )

Pheatmap绘制多分组热图

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生信阿姨
发布于 2022-11-21 15:51
阅读 ( 2079 )

seqkit序列处理神器的常用命令

seqkit是一个序列处理神器，有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令，详细内容如下

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星莓
发布于 2022-11-18 17:22
阅读 ( 7003 )

名额有限-组学大讲堂共享云服务器开售了！

组学大讲堂云共享服务器上线！

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生信老顽童
发布于 2022-11-18 11:24
阅读 ( 4392 )

duplicate_gene_classifier统计全基因组不同类型复制事件的数目

duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序，用于基因分类，统计全基因组不同类型复制事件的数目。命令行格式： $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写，是Dl.blast文件。在运...

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rzx
发布于 2022-11-16 14:00
阅读 ( 4552 )

hmmer之hmmbuild用法

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生信阿姨
发布于 2022-11-14 11:37
阅读 ( 3500 )

Linux安装细胞器组装软件--GetOrganelle

GetOrganelle软件是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具，可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。

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星莓
发布于 2022-11-14 11:18
阅读 ( 4035 )

Rocky 9下Rstudio-service配置教程

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安生水
发布于 2022-11-08 14:28
阅读 ( 2721 )

HMMER ——hmmsearch 用法，参数

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生信阿姨
发布于 2022-10-31 15:11
阅读 ( 6457 )

GATK4对于大量样品的项目进行变异检测

GATK4

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安生水
发布于 2022-10-31 12:49
阅读 ( 2243 )

GATK4进行变异检测是否可以多线程