转录组 - 文章 - 组学大讲堂问答社区

华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析

0
0
omicsgene
发布于 6天前
阅读 ( 68 )

SAW华大时空软件使用

0
0
omicsgene
发布于 2025-06-19 14:45
阅读 ( 80 )

空间转录组实操课程

0
0
omicsgene
发布于 2025-06-18 12:01
阅读 ( 156 )

空间转录组动力学分析

0
0
omicsgene
发布于 2025-06-05 16:29
阅读 ( 213 )

空间转录组细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

空间细胞共定位分析结果解读 MISTy分析

0
0
omicsgene
发布于 2025-05-26 18:11
阅读 ( 436 )

植物单细胞转录组文章

单细胞转录组文章

0
0
omicsgene
发布于 2025-05-13 10:31
阅读 ( 414 )

NCBI下载的10X 空间转录组数据如何读入spaceranger

spaceranger

0
4
omicsgene
发布于 2025-05-07 13:28
阅读 ( 569 )

空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)

0
0
omicsgene
发布于 2025-04-08 14:31
阅读 ( 701 )

《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

0
0
安生水
发布于 2025-03-17 16:01
阅读 ( 614 )

用AI写代码批量整理GEO数据库中的单细胞数据

用AI写代码只批量链接GEO 10X数据：

0
0
omicsgene
发布于 2025-03-14 18:42
阅读 ( 693 )

检查kegg的map是否能和差异基因对上

我们进行kegg富集分析之后，除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息，还会拿到kegg pathway map的信息，分为html和png的结果展示，大概是这样的结果：一般来说我们最好检查一下，这里...

0
0
Ti Amo
发布于 2025-02-24 16:07
阅读 ( 573 )

超长染色体的转录组分析注意要点

不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同，但是当我们做的物种有一个庞大的基因组，那么流程中有一些参数需要进行修改： 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引，主要是 Markdup的...

0
0
Ti Amo
发布于 2025-02-20 14:42
阅读 ( 559 )

拟南芥叶单细胞分析流程

拟南芥单细胞分析流程

0
0
omicsgene
发布于 2025-01-23 14:41
阅读 ( 726 )

非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建

0
0
omicsgene
发布于 2025-01-14 16:09
阅读 ( 738 )

单细胞转录组镜像代码更新4.0

0
0
omicsgene
发布于 2025-01-13 11:48
阅读 ( 1366 )

inferCNV 测试

0
0
omicsgene
发布于 2025-01-10 11:26
阅读 ( 789 )

单细胞转录组-inferCNV拷贝数变异分析介绍

0
0
omicsgene
发布于 2025-01-10 10:52
阅读 ( 1997 )

scanpy 中 ScTransform分析：

0
0
omicsgene
发布于 2024-11-20 08:23
阅读 ( 1140 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌（HNSCC）(GSE181919)

数据介绍：来自谷歌翻译：肝细胞癌（HCC）代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里，我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组：原发肿瘤、门...

0
1
omicsgene
发布于 2024-10-31 14:05
阅读 ( 1195 )

单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

0
0
omicsgene
发布于 2024-10-29 09:47
阅读 ( 1049 )