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我在构建进化树的时候,分类依据是拟南芥的分类和进化树本身的特点,但发现有的成员分类错误,采用ML法,校正参数Bootstrap设置为1 000次重复,结果出来后却发现,AtLC10本应该在第二组,AtLC13应该在第三组,但实际的结果恰恰相反,之后我又换了NJ法,结果还是不理想,依然有成员分组混乱,不知道我是哪里做的不对,希望得到指导。(AtLC10:AT5G01190.1,AtLC13:AT5G07130.1)
MEGA
辣味牛奶
2019-11-28 08:12
1
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老师好!我的物种基因注释水平在scaffold,之前课程里面的思路和脚本是否还适用?我需要有什么注意事项?附有参考文献分析方法和数据。求老师指导。感谢!
Big颗
2019-11-27 19:31
1
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删除哪个?
GFF
.Bubblehead
2019-11-27 18:52
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6343
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想请教老师热图里的Row-z-score和Column-z-score分别是如何计算。我的数据热图用Row-z-score画完结果显示与实际数值不大对,选column好像才对。
heatmap
hqhk0308
2019-11-27 17:57
1
回答
1836
浏览
发现一个基因通过domain_xulie.pl提取的位置与SMART鉴定时的domain、cdd的domain的位置不一样,有长有短,怎么办
枫
2019-11-27 12:29
2
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3634
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RNA-seq分析建立基因组index遇到问题
RNA-seq
没有角的龙
2019-11-27 09:20
2
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MCScanX共线性分析出错,请问如何解决?
White★
2019-11-26 18:58
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启动子分析,使用get_promoter.pl提取上游序列时发生如下报错(不能读取脚本第21行),请问该怎么修正啊?
White★
2019-11-26 16:59
2
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ITOL最近打不开
iTOL
当霸总
2019-11-25 23:54
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解决
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MCSCANX共线性分析原理和串联重复分析
MCScanX
余生
2019-11-25 20:39
3
回答
3282
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请问blastp比对后再提取结构域,结果是空文件,这是怎么回事呢?
blastp
White★
2019-11-25 15:35
1
回答
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/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7 运行不下去,出现下面的情况,请问是不是我的python有问题?
python版mcscan
2019-11-25 10:38
2
解决
3755
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分化时间计算中的r值
KaKs
余生
2019-11-24 18:57
2
回答
6303
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TBtools无法使用和更新
TBtools
White★
2019-11-24 18:15
2
回答
2444
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运行meme motif analysis时报错,无meme文件,locate也找不到biosoft或meme-v4.12.0
meme
White★
2019-11-24 14:05
1
回答
2288
浏览
请问这种作物模型图怎么做呀
作图
没有角的龙
2019-11-22 10:58
1
回答
4466
浏览
老师您好,我在安装GraphPad Priam时,老是出现如下问题,换了几个下载地址都是这样的问题,一直安装不了。求解决方法!!!
graphpad
杨辉
2019-11-21 21:51
0
回答
2494
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用CoNet进行OTU互作网络分析时如何筛选去网络中的关键节点、枢纽或者物种(network hubs)?
网络图
475496334@qq.com
2019-11-21 21:12
0
回答
1504
浏览
老师您好,我在用conet对自己数据分析时,总是报错,具体数据格式有什么要求吗
水波mvp
2019-11-21 18:54
1
回答
2599
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biolinux导入虚拟电脑失败,报错 返回 代码: E_INVALIDARG (0x80070057)
White★
2019-11-21 15:56
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