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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

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binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

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想咨询一下，宏基因组功能注释的视频中，有一步是用cds.fa文件注释物种，想咨询一下，这个物种注释出来后，应该如何计算丰度？是根据前面cds.count来计算吗，这样计算出的物种丰度可靠吗？因为有些物种可能基因很多。

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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

1 解决

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  • 2024-12-31 12:09
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10 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

  • YYJ 2024-12-30 20:45
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20 群体遗传构建进化树格式转换报错

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重测序BWA比对率低

  • BJFU 2024-12-30 08:50
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ggtree.r进化树问题

  • BJFU 2024-12-30 08:43
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运行go_enrich.r报错

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群体遗传分析数据过滤

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老师您好，我在保存镜像时报错了，请问这是什么原因呢

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这种情况怎么解决

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为什么搜索讲堂的镜像和blast镜像都失败了呢

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这怎么添加ID或者是不是我下的文件的问题，那种文件是有ID的

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这是我的文件名泛基因家族提取cds和pep的脚本应该怎么改呢

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参考基因组这个docker怎么练到filezilla，为什么我没法安装openssh或者filezilla，我应该怎么做

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putty下载基因组数据太慢