1 回答

有两个基因不在染色体上在contig上，为什么会这样，图片里的contig可以删掉吗，会有什么影响吗

2 回答

单细胞测序FindAllmarkers

2 回答

加载本地镜像，中断之后再也加载不起，咋整？

2 回答

保留蛋白编码基因运行就这样，不能回到docker ，怎么解决？

0 回答

请问pfam 模型下载选择那个是？ hmm后缀的文件还是seed 文件？

1 回答

fastsimcoal

  • lint 2025-03-21 10:37
0 回答

15 CCS报错---unsupported sequencing chemistry combination

  • K.K. 2025-03-20 22:00
3 回答

进不去docker，镜像，虚拟机。

1 回答

基因家族结构分析，为什么会出现下图图形盖住基因名的情况，怎样可以改正呢

0 回答

老师您好，我在运行这段代码时没有任何反应，请问是出现了什么问题？Oryza文件里是水稻的参考基因组

1 回答

老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15
0 回答

执行ALLHiC分组不成功

0 回答

3 二次搜索时提示新建立的domain_new.hmm没有TC阈值

  • 2025-03-15 15:54
0 回答

eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

1 回答

在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误，

0 回答

10 老师，请问为什么我的evolview颜色设置和设置基因名称不匹配？

0 回答

老师您好，我想问一下，一个鉴定出来的基因ID它的CDS序列开头是TAC而不是ATG,那这个基因可以保留吗

1 回答

在进行GWAS的LDBlock可视化中，在Win11本地的Docker执行LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region Chr1:36000000-37000000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt -PointSize 0.8命令时，程序居然报错UnKnow argument -PointSize，请问这是怎么回事呢，如何解决呢？请组学大讲堂的老师麻烦回答一下！谢谢！

  • John 2025-03-12 16:57
1 回答

GWAS分析发现的问题如下：第一，过滤水稻vcf的RawData时（群体有176份），我选择的minGQ值为20（同时要移除InDel），结果得出过滤出来的SNPs数量不足1000，但是我查过一些资料，GQ值如果群体数量较少值不得小于20。请问遇到这种情况如何处理，可否将最小GQ按照课程的脚本设置为0呢。 第二，你们的GWAS课程提供的计算BLUP的脚本是否在不同物种之间通用 第三，做GWAS时，基因型填充对后续的分析有什么意义。 第四，你们GWAS课程有没有计算遗传力相关的脚本。

  • John 2025-03-12 15:37
2 回答

我在win11本地GWAS分析时，进行plink。结果报错了（Segmentation fault （Core dumped）），请问各位如何解决

  • John 2025-03-12 15:36