是不是除了demo里的文件,其他的都要下载,或者替换为自己的品种,我看有的数据可能是加载环境。
构建泛基因列表,只需要把自己01.data_prepare时生成的longest_isoform.gff3和gene.cds.fasta文件链接过来作为数据去生成bed和cds文件就行。因为构建泛基因列表w.sh文件中的“# 提取最长的转录本”“# 提取cds”“# 改cds的名字为基因名字”步骤已经在01.data_prepare时完成了
并且不需要示例数据pangenlist里面的文件