TCGA处理之后的组学数据和临床信息个人是可以直接下载的,但是影像数据可能需要申请才行;
1. 基因组数据
- mRNA表达数据(RNA-Seq、microarray)
- miRNA表达数据
- DNA甲基化数据
- 蛋白质表达数据(如RPPA)
- 基因拷贝数变异(CNV)
- 突变数据(Mutation calls,SNV等)
2. 临床数据
- 患者的基本信息(年龄、性别、种族等)
- 肿瘤分期、分级
- 生存时间(OS、DFS)
- 治疗信息(手术、放疗、化疗等)
- 随访信息
3. 样本元数据
- 样本类型(肿瘤组织 vs 正常组织)
- 平台信息、测序中心、数据生成方法等