请问个人怎么才能下载到TCGA的组学,临床和WSI影像数据?

请问个人怎么才能下载到所有的TCGA的组学,临床和WSI影像数据?

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

TCGA处理之后的组学数据和临床信息个人是可以直接下载的,但是影像数据可能需要申请才行;

1. 基因组数据

  • mRNA表达数据(RNA-Seq、microarray)
  • miRNA表达数据
  • DNA甲基化数据
  • 蛋白质表达数据(如RPPA)
  • 基因拷贝数变异(CNV)
  • 突变数据(Mutation calls,SNV等)

2. 临床数据

  • 患者的基本信息(年龄、性别、种族等)
  • 肿瘤分期、分级
  • 生存时间(OS、DFS)
  • 治疗信息(手术、放疗、化疗等)
  • 随访信息

3. 样本元数据

  • 样本类型(肿瘤组织 vs 正常组织)
  • 平台信息、测序中心、数据生成方法等
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  • Sasa 提出于 1天前

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