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RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节出现以下问题

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析这一环节出现一些问题，ggplot版本问题

2 解决

10 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后，染色体出现了一个超级染色体，各染色体大小分布非常不均匀

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老师，我在构建泛基因列表时，做cat pangene_filter.*lifted.anchors | grep -v "^#" | awk '{print $1"\t"$2}'> ../03.jcvi-pan-vs-genome/syn.txt这一步，找不到pangene_filter.*lifted.anchors 是怎么回事

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老师您好，分析SNP和INDEL时报错，请解答。

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重测序分析

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GO富集分析气泡图怎么画

  • lw 2025-03-02 17:25
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提取VCF 文件里的SNP

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请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢，完全粘贴课程内容中的conf配置文件

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老师您好，我在参考基因组比对的时候，出现报错，请老师解答

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你好，我也遇到了一样的问题：docker里omicsclass的镜像都搜索不到了，然后下载omicsclass/gene-family:v1.0.1也报错，联系客服也没有回应，可以请教一下你是怎么解决的吗

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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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老师您好，我在参考基因组比对的时候出现报错

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老师您好，在参考基因组比对时出错。

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老师您好，我的重测序数据在NCBI上按照（双端下载是这样：https://www.omicsclass.com/article/1703）这个教程下载的，但是在做数据质控的时候总是报错，以下是数据，您看看哪儿存在问题。

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重测序分析

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绘制核心基因和可变基因饱和曲线时提示错，检查文件没有问题。

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数据质控出现报错

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老师，构建泛基因列表使用的vcf文件，是下面图中的sv数据吗，下面表格包括了CHROM，POS，REF，ALT，TYPE，MAF,MIS，ANN，将这些数据整理成vcf吗？

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请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？