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老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

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序列相似的家族基因如何设计荧光定量引物？

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泛基因筛选最长转录本时出现问题

  • Yang 2025-07-03 22:25
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泛基因家族分析数据准备

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5 原核生物建立基因组索引出现问题，没有gtf在文件

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泛基因家族分析家族成员存在缺失分析，获取PAV_gene.list和Fam_gene.list

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LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region scaffoldC01:46993000-46994000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pvalue.txt这条代码如何修改能使中间的字体大一点

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使用独享服务器A，256G内存，hifi组装t2t基因组（基因组1g，hifi测序60x），命令运行很久后，竟然自动kill，是内存不够吗

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请问个人怎么才能下载到TCGA的组学，临床和WSI影像数据？

  • Sasa 2025-07-01 10:16
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基因组使用ont.fasta数据补gap时报错

  • _He. 2025-06-30 18:25
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老师我的基因组都是Scaffold，没有染色体级别的基因组，这种适合做泛基因家族鉴定么。我是在BnPIR(http://cbi.hzau.edu.cn/cgi-bin/rape/download_ext)下载的

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老师，我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建，我是不是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去，不用再建文件夹下载了，然后一步步做Rstudio的操作么，我需要下载pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器？

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老师，cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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蛋白3D结构预测

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蛋白3D结构预测

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cellranger count 报错：job failed in stage code怎么解决

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老师，我手动生成了domain_final.bed，但是出现了以下情况，检查了相关文件都能打开，我是做成和share文件里domain_final.bed一样的txt格式，然后在FZ上加后缀bed改为bed格式，请问哪里有问题

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蛋白3D结构预测

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5 叶绿体基因组组装过滤代码错误

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老师我这次{ind}.FAE1_hmmerOut.final.txt都只有一个了，list文件正常，前一步生成的{ind}.FAE1gene.pep.fa也正常，这该怎么办