dadi 分析

θ = 17446.42 nu1=0.0855 nu2= 0.0833 m12= 10.5131 m21= 5.9871 T= 0.0933

根据这个模型我计算出来了这些参数，物种是山羊，我想知道这个T是不是指的基因交流时间？怎么计算出这个时间，还需要哪些参数？另外，nu1 和 nu2是指的种群大小吗，怎么计算出这个具体的值，m12 和 m21 代表的什么？

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2 个回答

Ti Amo 5天前

参数意义与使用参考：dadi
实例解读参考：Molecular Ecology | Molecular Genetics Journal | Wiley Online Library
m12表示群体1到群体2的交流，m21同理。

随风 5天前

这些内容看了还是不太懂，你们课面讲的有: L= 总序列长度 *分析用SNPs位点数/所有的SNPs位点数这个总序列长度是基因组的长度吗？另外，所有的SNPs位点数怎么确定？这个公式里面的值是从哪里来的？请帮我仔细解答一下，谢谢。