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请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度，有什么教程吗

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想咨询一下各位老师，宏基因组注释的时候，我有总共160G的土壤宏基因组数据(21个样本)

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请问个人怎么才能下载到TCGA的组学，临床和WSI影像数据？

  • Sasa 2025-07-01 10:16
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这怎么添加ID或者是不是我下的文件的问题，那种文件是有ID的

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基因家族分析中的顺势作用元件分析问题

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老师您好，我在进行megahit组装后运行quast.py这段出现报错，查看megahit.log文件后，出现的最后一行command的信息为Exit code -15,请问这是怎么回事呢？

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重测序分析

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老师，您好，我正在泛基因家族分析，想问课程中用到的结构变异的vcf文件all_merge.vcf是泛基因组全基因组范围的变异吗，

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#提取cds 用基因的id，作为序列的id；；1.这条指令如何修改，我想保留第一个pbr013511.1，这条指令只能保留中间部分 2.提取完cds和pep后，>DAnjou后面的内容，没有基因ID，ANQ为他的gff3文件 3.同样也是提取完cds和pep之后，>后面内容无基因id；DL为gff文件

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拟时分析筛选出的差异基因数量太少，有没有可以调整的参数去增加筛选数量

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对宏基因组数据进行αβ多样性分析时，进行抽平处理是不是会更好，然后进行微生物组成功能的差异分析时，需要做抽平处理后再求相对丰度吗

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请问跟着教程做的时候，无法下载omicsclass/reseq:v1.1，老师您能提供一份在线下载链接吗？

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宏基因组分析，用来分组的metadata格式具体是什么？

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修改样本名称

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tgsgapcloser报错

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这种情况怎么解决

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老师您好，我在运行collapse_samples.py这段代码用于物种注释时出错，出错信息为 qiime.parse.QiimeParseError: No header line was found in mapping file.请问该如何解决？

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IBD 计算2

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老师，进行结构变异分析时得到了tsv数据，请问需要转变为vcf文件吗？如果需要的话如何转变呢？

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如何删除01.data prepare呢？