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建立索引时出现报错，但依旧出现了一些文件，想问问报错原因怎么处理

  • xxx 2026-01-07 15:24
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但我后面加了$之后它先是报错没有index目录，创建之后运行不报错但没有运行结果

  • xxx 2026-01-06 14:41
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nucmer比对出现问题，导致部分样本没有结果

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想知道sh scriptdir/index.sh怎么创建才能用于索引建立，输入指令显示不存在

  • xxx 2026-01-06 10:38
3 解决

我更改文件名之后还是会复制不成功，这条命令应该怎样更改才正确，位置路径在R中显示是home/gene/genome

  • xxx 2026-01-04 15:37
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泛基因组基因家族_PAV分析，核心和可变基因富集分析问题

  • Oho 2025-12-25 09:56
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叶绿体比较基因组分析你好，我组装好的Fasta文件是一条一条的，课程里重复序列和多态性分析用的示例文件是总all.fasta,我需要怎么能整合起来，一条条好像也分析不成

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使用Launch_PASA_pipeline.pl 脚本报错

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10 在做HIC PRO,如果是双酶切。 那ligation site应该怎么写

  • 2025-11-12 15:28
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借助转录组辅助基因组注释

  • _He. 2025-10-19 23:21
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deepTE.py报错

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泛基因集执行命令时，由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗？我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因，是什么原因？这正常吗

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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答

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泛基因组分析中26Pan-genes.list这个文件在自己要分析的物种中怎么生成？没有相关方法介绍

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老师您可以分享一下buildRepeatSummary.pl脚本嘛

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请问各位老师有没有像用脚本buildSummary.pl统计out文件一样的可以用于统计gff格式重复序列注释文件的脚本？

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在基因家族筛过程CD-searcch结果中如果显示结构域N端C端或者NC端不完整，这个序列还能留做某一基因家族成员吗

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基因组组装BUSCO多拷贝过高

  • 2025-09-17 09:25
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老师，就是我在用misa鉴定ssr的时候，把文件输进去出现下面这个问题怎么解决，用你们提供的数据也是一样的问题，我找不到原因

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执行cat ../id.txt|while read ind;do ln -s ../data/${ind}.fa.gz ./ ln -s ../data/${ind}.gff3.gz ./命令时，打开01.data_prepare文件里面的内容显示如下图所示