泛基因家族分析

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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答

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泛基因组分析中26Pan-genes.list这个文件在自己要分析的物种中怎么生成？没有相关方法介绍

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执行cat ../id.txt|while read ind;do ln -s ../data/${ind}.fa.gz ./ ln -s ../data/${ind}.gff3.gz ./命令时，打开01.data_prepare文件里面的内容显示如下图所示

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存在缺失分析

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存在缺失分析

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结构变异与保守结构域分析

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泛基因家族分析，Ka/Ks分析

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泛基因家族系统发育树

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泛基因家族成员鉴定

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omicsclass/pan-gene-family 为啥这个我在docker hub上没有找到呀

  • Ymelk 2025-07-17 10:27:14
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泛基因家族分析结构变异与基因表达分析

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泛基因家族分析家族成员存在缺失分析，获取PAV_gene.list和Fam_gene.list

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老师，为什么我得到的Fam_gene.list中大多都是独有的，特别是参考基因组，全部都没有同源基因，那么我接下来结构变异与基因结果和保守结构域分析时，无法比对，该怎么往下做呢?

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泛基因家族分析之Fam_gene.list

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老师，我正在做泛基因家族分析中结构变异与基因结构和保守结构域分析，

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