泛基因家族分析

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结构变异与保守结构域分析

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泛基因家族分析，Ka/Ks分析

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泛基因家族系统发育树

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泛基因家族成员鉴定

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omicsclass/pan-gene-family 为啥这个我在docker hub上没有找到呀

  • Ymelk 2025-07-17 10:27:14
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泛基因家族分析结构变异与基因表达分析

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泛基因家族分析家族成员存在缺失分析，获取PAV_gene.list和Fam_gene.list

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老师，为什么我得到的Fam_gene.list中大多都是独有的，特别是参考基因组，全部都没有同源基因，那么我接下来结构变异与基因结果和保守结构域分析时，无法比对，该怎么往下做呢?

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泛基因家族分析之Fam_gene.list

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老师，我正在做泛基因家族分析中结构变异与基因结构和保守结构域分析，

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从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息

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老师，在泛基因家族分析结构变异的基因注释中，提取vcf文件有用信息列，$14是哪个

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老师，我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建，构树过程中，出现以下的过程及警告，请老师帮忙看看是否正常，这些重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

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老师我做存在缺失分析部分，Fam_gene.list中泛基因编号为什么不是连续的呢

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老师，以下是我的基因家族列表，基因组ID文件，基因家族泛基因列表，以及独有家族基因，下一步要做统计家族成员数量、排序及存在缺失分析，请老师帮忙看看，由于我的基因组名称中C01-C09，L01-L09,Q01-109还有另xiaomi等基因组名称与基因id命名对不上，该怎么修改，以上我没有自己修改内部任何内容

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