基因家族成员鉴定 - 组学大讲堂问答社区

基因家族成员鉴定

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各位老师好，请问我研究的是玉米泛基因家族，学习了泛基因的课程。这个家族搜索不到pf号，只有拟南芥鉴定出来的20条序列，我用这20条序列构建了一个hmmer文件，后面应该怎么和blast结合，以及应该怎么查看结构域，感谢解答~

1841854933@qq.com 2026-04-17 18:58:59

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基因家族分析-基因家族成员鉴定

一枚安静的咸鸭蛋～ 2024-05-24 20:47:47

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老师，如果用CDD(Batch CD-Search)搜索鉴定，出现这种情况，通常是什么原因？

Fighting! 2020-07-22 22:29:24

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进行基因家族成员鉴定的时候，是不是在hmmsearch搜索后，只要用CDD或Pfam鉴定出含有该基因家族的保守结构域，就可以认为该基因属于这个家族吗？

Fighting! 2020-07-22 15:01:50

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图中的用蛋白分子量筛选，那个蛋白分子量的筛选范围是所有基因家族通用的，还是仅限于Hsp20基因家族

Fighting! 2020-07-22 14:57:01

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我想问一下，对于MADS-box这种辅助域的Pfam号和DNA-binding的Pfam号不同的基因家族，做成员鉴定的时候，需要下2个种子序列不？

Fighting! 2020-07-17 21:52:23