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最近动态

2025-07-02 10:16 发起提问

LDBlockShow -Cutline 7 -InVCF $vcf -OutPut LD.p \ -Region scaffoldC01:46993000-46994000 -OutPng -SeleVar 2 -InGWAS ld.pval

2025-06-21 15:33 发起提问

在进行进化树分析时，运行出clean.sorted.vcf.gz文件后，后续文件跑不出来了，报错原因如图所示

2025-06-12 19:23 发起提问

run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess clean.sorted.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这条代码跑不出

2025-05-21 19:26 发起提问

putty打开没反应

2025-05-21 15:00 发起提问

我的fasta文件是由scaffold组成的，不是直接的A01和C01之类的，然后我现在用现有的文件以Gapit方式跑曼哈顿图时报错，该怎么调整

2025-05-15 18:16 回答问题

Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时，输入这段代码后，报

油菜中双11的参考基因组19条染色体

2025-05-15 16:19 发起提问

Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r -i pvalue_$m.txt -F $FAI -T Sugar_$m -n Sugar_${m}_manhattan -c 1.3e-6绘制曼哈顿图时，输入这段代码后，报

2025-05-14 22:56 发起提问

Rscript $scriptdir/gapit_gwas.r -i /work/hapmap.txt.gz -t /work/Sugar.txt -m GLM -n hd.GLM.GWAS.Results 就是我执行完这个命令，一直在这个界面，等一

2025-05-14 13:45 回答问题

perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决

这不应该对的吗

2025-05-13 13:47 发起提问

perl $scriptdir/vcf2hmp.pl all_clean.vcf.gz hapmap.txt.gz始终显示找不到脚本，但脚本在我设置的路径中，不知道该怎么解决