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juice box调整hic挂载数据

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泛基因家族分析，系统发育树构建

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泛基因组分析教程中的env.sh文件运行自己相应物种时，里面的命令行是不是要进行修改如下图所示

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PSMC分析

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allhic进行染色体挂载，分组过程k=20，只分了一个组出了

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16S课程 02.feature_table #16S 分析 deblur

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5 课程咨询

  • 2026-01-17 16:14
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分别用FarmCPU和BLINK做GWAS，从Q-Q图看BLINK模型更优，但是FarmCPU曼哈顿图有峰

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10 对gff文件进行处理，保留注释信息中能编码蛋白的基因。得到的结果文件‘.protein_coding.gff3’是空的，应该怎么办。所有品系都出现了这个问题。

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泛基因家族-热图

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kneaddata做质控的时候，服务器卡死了，用trimmomatic+bowtie2分开跑是可以的吧

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Xpclr

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dadi分析

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轨迹分析出现killed报错

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老师，图1是我用图2的代码实现的，现在我想仿照提取细胞亚类的方式，使用图3的代码单独提取TIP这个maker基因，不提取整个cluster3，这个代码可以实现吗，或者是否有其他代码可以使用

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10 成功启动镜像，进入容器，把课程资料下载到本地并解压缩，还是找不到课程资料

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对代谢数据的黄酮和酚酸与转录组进行WGCNA分析，如何准备文件？

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使用Launch_PASA_pipeline.pl 脚本报错

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老师，就是我组装叶绿体基因组，组装出来怎么是这个鬼样子啊，而且只有embplant_pt.K105.scaffolds.graph1.1.path_sequence.fasta，没有1.2， 这是什么问题呀

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单倍型分析