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老师您好,基因家族鉴定的时候,要求使用 GA 阈值重新运行 hmmsearch 分析保守结构域。请问这个GA阈值是什么啊,应该怎么操作呢
满城
3天前
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泛基因家族分析PAV_gene.list中基因数量,少于gene.pep.fa中序列的数目
中华鲟
2025-10-13 19:15
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泛基因家族分析-SV和表达量
生信小白
2025-09-28 21:02
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请问win11家庭版上刚开始基于hyper-v安装了docker,后来调整docker设置变成基于WSL2安装docker,然后请问这样可行吗?怎么使用?
杨辉
2025-09-16 11:45
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组学大讲堂的一个T2T组装培训课,在进行组装前先除去了和细胞器DNA高度相关的reads。但是我看现在大部分的文章没有特别处理细胞器的DNA,是在组装的过程中已经被除掉了吗?
yuechao
2025-09-13 23:02
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请问现在T2T的组装,还需要先除掉和细胞器DNA相关的reads再进行组装吗?组学大讲堂的课里面除掉了相关的reads。但是我看现在的论文,似乎都没有对细胞器的DNA进行单独的处理。
T2T基因组组装
yuechao
2025-09-13 22:22
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PGGB泛基因组报错
图形泛基因组
李昂
2025-09-11 21:42
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在全基因组选择育种课程中,所有需要预测的样本(在 pred_ID.csv 中列出的ID),必须已经存在于那个巨大的基因型文件 imputed_snp.raw 中,是否就意味着我只能预测现有群体的缺失部分?我需要预测新的群体,那这 pred_ID.csv文件该如何编写?
陈帮鑫
2025-09-09 11:08
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tree_tax出错
cashing
2025-09-03 15:29
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转录组比对中,同源性很高的两个基因比对不正确
同源基因
比对定量
转录组分析
山枫
2025-09-01 14:27
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mcmctree运行很长时间
山隹
2025-08-29 10:05
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16S课程 02.feature_table #16S 分析 deblur
16S
zhangshi
2025-08-27 20:57
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plink做pca报错
pilnk
Ccccccc
2025-08-18 17:38
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kneaddata做质控的时候,服务器卡死了,用trimmomatic+bowtie2分开跑是可以的吧
质控
murakami
2025-08-15 22:52
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老师,您好!全基因组选择,利用自己的SNP数据(芯片SNP)进行基因型数据处理,beagle.27Feb25.75f.jar处理完成后,得到的imputed_snp里面没有SNP标记信息。
小石
2025-08-14 17:47
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老师您好,我在搭建t2t基因组时候,hic挂载时,使用bwa aln和sampe比对时说版本不一致无法使用,查找原因说是因为大于100bp,现在使用bwa mem比对后就格式不一样,使用课程里的allhic的PreprocessSAM.pl和filterBAM_forHic.pl就无法使用了,格式不对,修改脚本后过滤出9.8g的bam文件,使用ALLHic_partition进行分组设置k=15,但是分组运行后只能分出1组,该怎么办呢?这是什么原因?
๑⃙⃘'ᵕ'๑⃙⃘
2025-08-12 18:03
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有参转录组数据分析,样品和基因组比对效率只有零点几,这是为什么?
naliupeony
2025-08-07 21:02
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5
Orthofinder报错出现ZeroDivisionError: float division by zero
orthofinder
进化树分析
多序列比对和进化聚类
huahua
2025-08-07 10:19
0
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练习数据上传
张谦
2025-08-01 18:39
0
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请问有fastsimcoal使用相关的课程吗,或者类似功能的软件
xinhj
2025-07-30 10:07
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