不是所有的基因家族都存在非常保守的结构域和由结构域构建的HMM模型。这种情况可以不选择hmmer鉴定,只选择blast鉴定的方法。具体可以借鉴该基因家族已发表的相关文献
我研究的家族是激酶家族,只用blast成员太多了,无法剔除,该基因家族发表的文献都看过了,并没有特别细致的解决方法