3 回答

20 从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻泛基因分析，无法获取longest_isoform.gff3文件

1 回答

5 在JGI上下载gff文件和fa.gz文件有问题，感谢答疑

1 回答

代谢组进行差异代谢物筛选时，必须对t检验的p值进行fdr矫正吗？我看到大多数论文里都是p值哎

0 回答

15 CCS报错---unsupported sequencing chemistry combination

  • K.K. 2025-03-20 22:00
2 回答

老师，用GLM模型跑Gwas时将数据替换成自己的后，出现了报错,分别截图了基因型文件，表型文件和报错信息，请老师解答。文件是用的tsv格式，只是用excel打开了，命令就是将脚本提供的命令中的文件改成了自己的文件

  • zjc 2025-04-09 10:53
2 回答

老师，以下是我的基因家族列表，基因组ID文件，基因家族泛基因列表，以及独有家族基因，下一步要做统计家族成员数量、排序及存在缺失分析，请老师帮忙看看，由于我的基因组名称中C01-C09，L01-L09,Q01-109还有另xiaomi等基因组名称与基因id命名对不上，该怎么修改，以上我没有自己修改内部任何内容

0 回答

老师，我正在做泛基因家族存在缺失分析作图作图这一步，前面由于ID.txt与基因家族列表对应不上，将ID.txt文件按照基因家族列表前缀进行了修改，并排序，但是得到的PAV_draw.list和PAV_gene.list,不确定对不对，且作不出图

2 回答

老师，我在做泛基因家族成员存在缺失分析时，做统计各个样本家族成员数量，及根据数量对基因组进行排序时候，由于我原始得到的maize.WRKYgene.list文件里的基因名称，和ID.txt文件里的基因组名称无法链接，有很多基因组无法识别出成员数量，（也就是因为这一步，我才把我上一个问题提的把基因名称及ID名称改掉了），请问怎么修改指令？

0 回答

可以给我分享一下您的基因家族镜像吗

  • 2025-04-07 11:02
1 回答

braker.pl运行中断

0 回答

3 二次搜索时提示新建立的domain_new.hmm没有TC阈值

  • 2025-03-15 15:54
1 回答

重测率，比对率

1 回答

保留蛋白质编码基因找不到gff文件，但是我是指定了路径的，而且ll也能找到这个文件，这个文件ee查看也看不出来问题

1 解决

GATK硬标记过滤速度慢

0 回答

老师你好，我在进行到基因结构分析structure这一步时，出现错误 望解答

  • 2025-04-07 10:10
0 回答

老师你好，我在进行到基因结构分析structure这一步时，出现错误 望解答，感谢！

  • 2025-04-03 18:04
1 回答

单细胞测序数据两个子集合并

  • Zzz 2025-04-27 17:18
2 回答

根据没有标识转录本是1还是2或3的IDlist基因号名单，在标识了转录本的蛋白质序列文件中搜索，可以把IDlist名单中的所有转录本蛋白序列搜索出来吗？可以改命令达成？这是我的命令seqkit grep -f Nramp_IDlist_final.txt arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa -o Nramp_pep_final.fa 我把IDlist里面名单后面都加了转录本号才搜出来。？

1 回答

GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

2 回答

10 群体遗传分析中iqtree构建系统进化树出现警告和错误