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基因家族一个基因的两个结构域序列重叠

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不能使用scripts中的vcf2map.pl脚本

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gwas分析报错

  • Jay 2024-11-07 15:40
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  • 2024-08-08 18:43
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5 ###16S/18S 方法1：dada2 数据质量过滤，合并，去嵌合，去引物一步完成。这个步骤代码报错，请老师帮我看一下这个问题，之前有帖子也有这个问题，说是建议下载咱们课程提供的docker镜像，我就是下载的咱们课程的docker镜像，但还是出现了这个问题，请老师解答，谢谢！

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已经windows系统里下载了docker 也打开了，但还是运行不了. doc.sh

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单细胞高级分析代码的报错求助

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问题1：这是我按照咱们视频里的方法做的Lefse，但它没有上面的小写英文字母，a,b,c,d,等的图例，请问如何添加呢，我看发表的文章中都是有图例的，如何改成第二张图这样呢，右上角标有细菌名字的图例。问题2：第三图中有other，请问这个直接在特征标里面更改吗，删掉注释为other的，这样可以吗，请老师解答，谢谢！

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已经发表的文章用的是两个隐马尔可夫模型，怎么样把搜索出来的数据合在一起呢？

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hmmsearch出现Segmentation fault (core dumped)

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老师，在生成gbcf文件后，发现只运行了前三个染色体的，是我的代码有问题嘛？该怎么解决啊？参考基因组的fasta，fai文件都是好的，前期生成的bam文件也是好的，样品是四倍体，参考基因组是异源四倍体

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data_qc处理

  • lw 2024-08-19 16:03
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有关于GSEA富集分析参数设置

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genome

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用W11安装docker后，docker search omicsclass出错

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数据质量查看出现问题

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我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析，输入了51个样本，但是最后就剩下了35个样本，如图所示，请问是那一步出现错误了，是 数据有问题还是写的参数有问题

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mcsanx作图问题

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泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后，显示没有权限

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差异基因分析有多组样本是出现以下报错

  • lw 2024-07-29 11:13