1天前 发表了文章

1天前 回答问题

chrorder调整的时候染色体条数发生改变了。不做这一步直接根据之前的delta和coords文件做syri。但是可能存在大结构变异也会导致call变异失败

1天前 回答问题

1. kmer评估中杂合度为多少？高杂合是否组装为两套染色体？高杂合未区分，D高2.物种是否为多倍体？有全基因组复制事件？如果存在，D高是正常情况。3.参考近缘种，与其他人busco的结果进行比较，看差异大不大，如果近缘种都是这样的结果可能是物种本身特性。 

2天前 回答问题

样本txt里面的名字和vcf的是否一致

3天前 回答问题

运行代码是：Rscript $scriptdir/trait_plot.r  -i $datadir/traits_gapit.txt ？格式是这个：

3天前 回答问题

检查输入文件./NorthAfrica-Yourawildgoat.sfs是不是有一行全是0。easySFS.py里面投影值设置根据自己样本数目进行更改

3天前 回答问题

很可能表型数据格式不符合标准。可以给出表型数据截图、写明自己操作命令以及报错。

3天前 回答问题

变量workdir没赋值。export workdir=/work/myt2t

2025-09-11 18:01 回答问题

gtf不符合标准格式

2025-09-11 10:01 回答问题

可以这样加速，切割部分的注释结果可能需要重新做一下