1天前 回答问题

ZS11.v0.gff3里面在你指定的这个区域存在方向的缺失（第 7 列），需要检查一下

4天前 回答问题

vcf基因组坐标区间采用了“倒位 断点上游 + 倒位区间 + 下游”的记录，ANNOVAR 使用 SV 的基因组坐标区间，你的 INV 被记录为覆盖从 GeneA 附近 到 GeneB 附近，注释按这个区间来。一个断点在 GeneA，另一个断点在 GeneB（或两者分别靠近两个基因），注释就会显示该 SV 影响 GeneA 和 GeneB。你可以检查一下断点是否在两个基因的外显子/剪切区？也可以在IGV加载 BAM + VCF确定倒位仅为 65 bp，而非 19 kb 。如果是按照现在你的描述去解释的话：该

2026-05-29 17:01 回答问题

看不到kill的原因，推测是内存或者存储问题

2026-05-28 09:26 回答问题

这个r脚本可以做改动（推荐优先更改宽高等信息），但是也不是全部适配的，直接ps或者ai修改吧。

2026-05-25 09:59 回答问题

需要hapmap.txt.gz文件内容的截图，报错是格式问题

2026-05-15 17:59 回答问题

有报错信息吗？hicxbly_aligned.REduced.paired_only.bam没问题的话可能xblysample.clean.sam的头文件不完整，并且要求BAM 和 SAM 的染色体/contig 名称必须完全一致，可以从这两个角度检查一下

2026-05-15 15:45 回答问题

极端假阳性了。可能群体分层严重、存在亲缘关系没有较正、表型数据被当作协变量输入等原因都有可能。换一个模型也是这样的结果吗？

2026-04-29 16:53 回答问题

红色失败表示在你软连接的绝对路径下面没有这个文件，需要你提供/work/my_pan-gene-family/data/下面得截图。在容器下面操作： l /work/my_pan-gene-family/data/

2026-04-28 10:30 回答问题

maf降低、maxmissing降低、minGQ降低，以及allels不限制那么死就可以增加可用位点。

2026-04-22 10:05 回答问题

这个是plink 1.9会出现的 ，自己升级到2.0就没事了。其实并没有真实的错误，可以看结果文件，也是全的。直接往下进行就可以了。