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为什么搜索讲堂的镜像和blast镜像都失败了呢

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IBD 计算2

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cnvpytor

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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后，Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆（如下图），请问如何修复（就是修改可视化Manhattan图的纵坐标）

  • John 2025-03-12 15:35
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大家好啊，新手一枚，请多关照哈

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析这一环节出现一些问题，ggplot版本问题

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重测序 htop 查看服务器使用

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老师您好，使用beagle进行基因型填充的时候参考文件放在哪里呀，课堂上的实例是水稻的，但是我做的是人类的，需要修改哪里吗

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用GATK call 变异的时候，分染色体还是很慢，能不能增加线程或别的改进的方法。

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并行运行

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5 老师您好，我在运行megahit对200多个环境微生物宏基因组数据进行组装时，megahit报错Exit code -9

  • Zz1 2025-05-27 10:13
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想咨询一下，我有1批宏基因组数据，可不可以样本对半，分成2次进行

1 解决

Hic挂载时 K值选择

  • _He. 2025-04-23 08:48
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5 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

2 解决

5 老师，我运行这条命令报错了，请问哪里出问题了 ，感谢老师

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RNA-SEQ有参转录组的课程，可以来分析全转录组数据吗

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LD绘图

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sed -i 'ls/Marker/chr\tpos/' glm_pvale.txt sed: -e 表达式 #1, 字符 2: 命令后含有多余的字符↵

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老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp是否处于一个高度连锁的区域，属于左边的block还是右边的block呢

  • 2024-12-08 23:43
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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释